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生鲜畜禽肉中沙门氏菌全基因组分析与分子溯源
引用本文:宋晟,高晗,严礼,郭焜鹏,张海韵,王芳斌. 生鲜畜禽肉中沙门氏菌全基因组分析与分子溯源[J]. 食品与机械, 2020, 0(9): 55-62,169
作者姓名:宋晟  高晗  严礼  郭焜鹏  张海韵  王芳斌
作者单位:食品安全监测与预警湖南省重点实验室,湖南 长沙 410117 ;湖南省食品质量监督检验研究院,湖南 长沙 410117
基金项目:湖南省市场监督管理局科技计划项目(编号:2019KJJH52);湖南省科技创新平台与人才计划项目(编号:2019TP1058)
摘    要:依据GB 4789.4—2016对从长沙市生鲜市场随机采集的生鲜猪肉、鸡肉进行检验。结果显示:有20份生鲜猪肉样品检出沙门氏菌,检出率为83.3%;有20份生鲜鸡肉样品检出沙门氏菌,检出率为74.1%;总检出率为78.4%。通过对其中40株沙门氏菌进行全基因组测序与分子溯源研究,结果表明:20株猪源性沙门氏菌与20株鸡源性沙门氏菌按分子溯源分析可分为5个明显不同的聚类,清晰反映了沙门氏菌的污染源分布及交叉污染情况,实现了精准溯源;其中发现了15个致病基因,从基因层面阐明了沙门氏菌可能存在的致病基因与致病机制,提示了沙门氏菌潜在的致病风险;试验发现了15个耐药基因,从基因层面阐明了沙门氏菌可能存在的耐药基因与耐药机制。

关 键 词:沙门氏菌;全基因组测序;系统进化树;分子溯源研究

Whole genome analysis and molecular traceability study of Salmonella in fresh livestock and poultry meat
SONG Sheng,GAO Han,YAN Li,GUO Kun-peng,ZHANG Hai-yun,WANG Fang-bin. Whole genome analysis and molecular traceability study of Salmonella in fresh livestock and poultry meat[J]. Food and Machinery, 2020, 0(9): 55-62,169
Authors:SONG Sheng  GAO Han  YAN Li  GUO Kun-peng  ZHANG Hai-yun  WANG Fang-bin
Abstract:
Keywords:
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