| 分离自人体肠道的副干酪乳杆菌K56和ET-22的菌株鉴定 |
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| 引用本文： | 刘艺茹,马霞,赵婷,刘锦浲,于学健,刘伟贤,程坤,张欣,曹艳花,辛迪,冯慧军,刘福东,赵雯,洪维鍊,姚粟.分离自人体肠道的副干酪乳杆菌K56和ET-22的菌株鉴定[J].食品与发酵工业,2022(1):62-69. |
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| 作者姓名： | 刘艺茹 马霞 赵婷 刘锦浲 于学健 刘伟贤 程坤 张欣 曹艳花 辛迪 冯慧军 刘福东 赵雯 洪维鍊 姚粟 |
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| 作者单位： | ;1.中国食品发酵工业研究院有限公司中国工业微生物菌种保藏管理中心;2.内蒙古乳业技术研究院有限责任公司;3.内蒙古伊利实业集团股份有限公司 |
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| 摘 要： | 以婴儿和成人肠道来源的菌株K56和ET-22为研究对象，选取8株其他来源菌株作为参考，采用形态学、生理生化、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱、全基因组测序、多位点序列分型分析和单核苷酸多态性(single nucleotide polymophism, SNP)分析，建立了适用于菌株K56和ET-22的鉴定方法。结果表明，菌株K56和ET-22及参考菌株的基质辅助激光解吸/电离飞行时间鉴定比对值大于2,平均核苷酸一致性值(average nucleotide identity, ANI)达到95%以上，在种水平均鉴定为副干酪乳杆菌(Lactobacillus paracasei);对副干酪乳杆菌K56、ET-22和参考菌株的1 701个共有核心基因开展基于全基因组测序的多基因序列位点分析，菌株K56和ET-22可与其他参考菌株有效区分，SNP分析表明不同培养代数间副干酪乳杆菌K56的SNP差异为103、ET-22的SNP差异为49,系统发育分析表明该方法可以有效区分副干酪乳杆菌K56、ET-22与其他参考菌株。益生菌的安全性和功能性均在菌株水平具有特异性，已成为业内新的科学共识。该研究...
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| 关 键 词： | 副干酪乳杆菌 菌株鉴定 全基因组测序 多位点序列分型 单核苷酸多态性 |
Identification of Lactobacillus paracasei K56 and ET-22 isolated from human intestine |
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| LIU Yiru,MA Xia,ZHAO Ting,LIU Jinfeng,YU Xuejian,LIU Weixian,CHENG Kun,ZHANG Xin,CAO Yanhua,XIN Di,FENG Huijun,LIU Fudong,ZHAO Wen,HONG Weilian,YAO Su.Identification of Lactobacillus paracasei K56 and ET-22 isolated from human intestine[J].Food and Fermentation Industries,2022(1):62-69. |
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| Authors: | LIU Yiru MA Xia ZHAO Ting LIU Jinfeng YU Xuejian LIU Weixian CHENG Kun ZHANG Xin CAO Yanhua XIN Di FENG Huijun LIU Fudong ZHAO Wen HONG Weilian YAO Su |
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| Affiliation: | (China National Research Institute of Food and Fermentation Industries Co.Ltd.,China Center of Industrial Culture Collection,Beijing 100015,China;Inner Mongolia Dairy Technology Research Institute Co.Ltd.,Hohhot 010110,China;Inner Mongolia Yili Industrial Group Co.Ltd.,Hohhot 010110,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Lactobacillus paracasei strain identification whole genome sequencing multilocus sequence typing single nucleotide polymorphism |
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