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| 一种关于蛋白质模体的自动识别算法 | |
| 引用本文： | 蔡振辉,戈晓斐,胡磊,黄晓. 一种关于蛋白质模体的自动识别算法[J]. 计算机技术与发展, 2004, 14(10) |
| 作者姓名： | 蔡振辉 戈晓斐 胡磊 黄晓 |
| 摘 要： | 随着生物信息学的发展,模体识别已经成为一种能够从生物序列中提取有用生物信息的方法.文中介绍了有关模体的一些概念,讨论了模体识别算法(MEME)的基础,即EM(expectation maximization)算法,由于MEME算法是建立在EM算法的基础上的,所以又由此引出了MEME算法,并对MEME算法的一些基本问题比如时间复杂度、算法性能等进行了详细讨论,对算法的局限性和有待改进的地方作了说明.实践证明,MEME是一个较好的模体识别算法,它能够识别出蛋白质或者DNA序列中单个或多个模体,具有很大的灵活性. |
| 关 键 词： | 模体 算法 最大期望值算法 MEME算法 |
An Algorithm of Automatic Discovery of Protein Motif |
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