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采用细胞神经网络快速校正生物芯片图像倾斜
引用本文:律睿憨,王淑蓉,罗正全,唐小萍,严伟.采用细胞神经网络快速校正生物芯片图像倾斜[J].光电工程,2008,35(11):33-37.
作者姓名:律睿憨  王淑蓉  罗正全  唐小萍  严伟
作者单位:1. 中国科学院光电技术研究所,成都,610209;中国科学院研究生院,北京,100039
2. 中国科学院光电技术研究所,成都,610209
基金项目:国家自然科学基金(60671046)
摘    要:倾斜校正是全自动生物芯片图像处理必不可少的环节。针对以往倾斜校正算法耗时过长,本文提出一种快速倾斜校正算法。算法首先用细胞神经网络(CNN)寻求各个样点的中心,然后进行Hough变换,再计算方差来寻求倾斜角,最后利用CNN灰度图像旋转模板进行倾斜校正。本算法利用了细胞神经网络并行处理的特性,并充分考虑了生物芯片图像的特点。理论分析与试验结果显示本文算法能够准确高速地完成倾斜校正。

关 键 词:生物芯片  微阵列  倾斜校正  细胞神经网络  霍夫变换
收稿时间:2008/2/26

Fast Skew Correction for Microarray Image Based on Cellular Neural Networks
LU Rui-min,WANG Shu-rong,LUO Zheng-quan,TANG Xiao-ping,YAN Wei.Fast Skew Correction for Microarray Image Based on Cellular Neural Networks[J].Opto-Electronic Engineering,2008,35(11):33-37.
Authors:LU Rui-min  WANG Shu-rong  LUO Zheng-quan  TANG Xiao-ping  YAN Wei
Abstract:Skew correction algorithm is indispensable in fully automated microarray image processing. Since most previous image skew correction algorithms for microarray were time-consuming,a fast skew correction algorithm was proposed based on Cellular Neural Networks(CNN). The first step was to obtain the center points of all spots by applying a series of CNN templates. The second step was to find out the skew angle by performing Hough transform and calculating deviation. The final step was to correct skew by CNN gr...
Keywords:biochip  microarray  skew correction  cellular neural networks  Hough transform  
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