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Profile覆盖算法在蛋白质二级结构预测中的应用
引用本文:郑婷婷 毛军军 吴涛 程家兴. Profile覆盖算法在蛋白质二级结构预测中的应用[J]. 微机发展, 2007, 17(9): 171-173
作者姓名:郑婷婷 毛军军 吴涛 程家兴
作者单位:安徽大学数学与计算科学学院,安徽大学数学与计算科学学院,安徽大学数学与计算科学学院,安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室 安徽合肥230039,安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室,安徽合肥230039,安徽合肥230039,安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室,安徽合肥230039,安徽合肥230039,安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室,安徽合肥230039,安徽合肥230039
基金项目:国家自然科学基金(60475017),安徽省自然科学基金(050420208),安徽省高校省级自然科学研究基金(2006KJ244B),安徽大学人才队伍建设基金
摘    要:介绍了构造性机器学习方法——覆盖算法在蛋白质二级结构预测中的应用。相比普通的神经网络,这种方法直观且运算简单,对训练样本可100%识别。同时,考虑到同源家族的结构应该比单条序列结构预测更准确,采用了基于概率的Profile编码方式,相比以往的预测方法,具有更好的稳定性和精确性。

关 键 词:氨基酸序列  蛋白质二级结构  覆盖算法  Profile编码
文章编号:1673-629X(2007)09-0171-03
修稿时间:2006-11-24

Application of Profile Covering Method in Protein Secondary Structure Prediction
ZHENG Ting-ting,,MAO Jun-jun,,WU Tao,,CHENG Jia-xing. Application of Profile Covering Method in Protein Secondary Structure Prediction[J]. Microcomputer Development, 2007, 17(9): 171-173
Authors:ZHENG Ting-ting    MAO Jun-jun    WU Tao    CHENG Jia-xing
Affiliation:ZHENG Ting-ting1,2,MAO Jun-jun1,2,WU Tao1,2,CHENG Jia-xing2
Abstract:
Keywords:amino acid sequences  protein secondary structure  covering algorithm  Profile encoding
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