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一种鉴定蛋白质突变和翻译后修饰的算法
引用本文:谢靖宇,谢深泉.一种鉴定蛋白质突变和翻译后修饰的算法[J].计算机工程与应用,2007,43(28):61-64.
作者姓名:谢靖宇  谢深泉
作者单位:湘潭大学 信息工程学院,湖南 湘潭 411105
摘    要:提出的MSA(Modified Spectral Alignment)算法,改进了SA(Spectral Alignment)算法中D(k)和k-最佳Spectral Alignment的求解方式,并在算法中引入“双端考虑”。实验结果数据表明,MSA算法有效地提高了鉴定含突变或翻译后修饰的蛋白质的能力。

关 键 词:蛋白质  翻译后修饰  突变  MSA算法  
文章编号:1002-8331(2007)28-0061-04
修稿时间:2007-02

Algorithm identifying mutations and post-translational modification of protein
XIE Jing-yu,XIE Shen-quan.Algorithm identifying mutations and post-translational modification of protein[J].Computer Engineering and Applications,2007,43(28):61-64.
Authors:XIE Jing-yu  XIE Shen-quan
Affiliation:College of Information Engeering,Xiangtan University,Xiangtan,Hunan 411105,China
Abstract:The algorithm MSA is presented in this paper,which improved the way to compute D(k) and k-optimal Spectral Alignment of SA algorithm and took into account simultaneous analysis of N-terminal and C-terminal ions.The experiment result data shows that efficiently improves the capability of identifying proteins containing mutations or post-translational modifications.
Keywords:protein  Post-translational Modification  mutation  MSA algorithm
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