| 新型核序列自相关函数用于非同源蛋白质结构类预测 |
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| 引用本文： | 金宏,周鹏,商志才. 新型核序列自相关函数用于非同源蛋白质结构类预测[J]. 计算机与应用化学, 2011, 28(1): 61-68 |
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| 作者姓名： | 金宏 周鹏 商志才 |
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| 作者单位： | 浙江大学化学系分子设计与应用研究所,浙江,杭州,310027 |
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| 摘 要： | 从天然氨基酸的50个性质参数中经主成分分析得出1种新的氨基酸描述子:氨基酸特征性质得分.并在此基础上通过定义基于向量形式的自相关函数以及引入Mercer核技术将该函数运算空间进行非线性变换,最终提出了1种新的蛋白质序列表征方法:核序列自相关函数.采用该函数对632个已知晶体结构的非同源蛋白分类研究结果表明:KSACF能...
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| 关 键 词： | 核序列自相关函数 氨基酸特征性质得分 蛋白质结构类预测 |
A novel kernel sequence auto-correlation functions applying to prediction of non-homologous protein structural classes |
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| Jin Hong,Zhou Peng,Shang Zhicai. A novel kernel sequence auto-correlation functions applying to prediction of non-homologous protein structural classes[J]. Computers and Applied Chemistry, 2011, 28(1): 61-68 |
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| Authors: | Jin Hong Zhou Peng Shang Zhicai |
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| Affiliation: | Jin Hong,Zhou Peng and Shang Zhicai~* (Institute of Molecular Design & Molecular Applications,Department of Chemistry,Zhejiang University,Hangzhou,310027,Zhejiang,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | kernel sequence auto-correlative function principal component scores of amino acid character property prediction of protein structural classes |
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