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铜绿假单胞菌实时荧光重组酶介导链替换核酸扩增方法建立及应用
引用本文:王金凤,项佳林,孙晓霞,李睿文,姜彦芬,陈志敏,刘立兵,王建昌,袁万哲. 铜绿假单胞菌实时荧光重组酶介导链替换核酸扩增方法建立及应用[J]. 中国食品卫生杂志, 2020, 32(5): 524-529
作者姓名:王金凤  项佳林  孙晓霞  李睿文  姜彦芬  陈志敏  刘立兵  王建昌  袁万哲
作者单位:石家庄海关技术中心,河北 石家庄 050051;河北省检验检疫科学技术研究院, 河北 石家庄 050051;河北农业大学动物医学院,河北 保定 071001
基金项目:河北省重点研发计划项目(19226636D);河北省现代农业产业技术体系羊产业创新团队(HBCT2018140204)
摘    要:目的建立一种快速检测铜绿假单胞菌的实时荧光重组酶介导链替换核酸扩增(real-time RAA)方法。方法基于铜绿假单胞菌ecfX基因设计特异性引物和exo探针,通过灵敏性、特异性和疑似菌株检测评估所建立方法的有效性。结果 Real-time RAA方法在39℃等温条件下反应20 min即可实现对铜绿假单胞菌的有效检测;特异性强,仅对铜绿假单胞菌出现特异性扩增;灵敏性高,对铜绿假单胞菌基因组DNA的检出限为3.0×10~3 fg/反应,对纯培养铜绿假单胞菌的检出限为1.0×10~3 CFU/反应。应用所建立的real-time RAA方法对分离的36株疑似铜绿假单胞菌进行检测,结果均为铜绿假单胞菌,同VITEK 2 Compact生化鉴定方法和real-time PCR方法结果一致。结论本试验所建立的real-time RAA方法反应快速、操作简单、可靠性高,可用于不同来源的铜绿假单胞菌的快速检测和鉴定。

关 键 词:铜绿假单胞菌   ecfX基因   实时荧光重组酶介导链替换核酸扩增   等温扩增
收稿时间:2020-06-03

Development and evaluation of a real-time recombinase-aid amplification assay for rapid detection of Pseudomonas aeruginosa
WANG Jinfeng,XIANG Jialin,SUN Xiaoxi,LI Ruiwen,JIANG Yanfen,CHEN Zhimin,LIU Libing,WANG Jianchang,YUAN Wanzhe. Development and evaluation of a real-time recombinase-aid amplification assay for rapid detection of Pseudomonas aeruginosa[J]. Chinese Journal of Food Hygiene, 2020, 32(5): 524-529
Authors:WANG Jinfeng  XIANG Jialin  SUN Xiaoxi  LI Ruiwen  JIANG Yanfen  CHEN Zhimin  LIU Libing  WANG Jianchang  YUAN Wanzhe
Affiliation:Technology Center of Shijiazhuang Customs, Hebei Shijiazhuang 050051, China;Hebei Academy of Science and Technology for Inspection and Quarantine, Hebei Shijiazhuang 050051, China;College of Veterinary Medicine, Hebei Agricultural University, Hebei Baoding 071001, China
Abstract:
Keywords:Pseudomonas aeruginosa   ecfX gene   real-time recombinase-aid amplification   isothermal amplification
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