| 植物乳杆菌DMDL 9010胞外多糖合成蛋白cpsB的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 梁婉诗,吴佳敏,林嘉伟,曹凯,宋炜桐,曾新安,刘冬梅,黄燕燕.植物乳杆菌DMDL 9010胞外多糖合成蛋白cpsB的生物信息学分析[J].现代食品科技,2024,40(3):113-120. |
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| 作者姓名： | 梁婉诗 吴佳敏 林嘉伟 曹凯 宋炜桐 曾新安 刘冬梅 黄燕燕 |
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| 作者单位： | （1.佛山科学技术学院食品科学与工程学院，佛山科学技术学院广东省食品智能制造重点实验室，广东佛山528225）;（1.佛山科学技术学院食品科学与工程学院，佛山科学技术学院广东省食品智能制造重点实验室，广东佛山528225）（2.华南理工大学食品科学与工程学院，广东广州 510640） |
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| 基金项目： | 广东省基础与应用基础研究基金项目（2022A1515110426）；广东省科技创新战略专项资金（2022B1212010015）；佛山科学技术学院高层次人才经费（CGZ07001）；企业委托项目（BKH208034） |
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| 摘 要： | 为了探讨植物乳杆菌DMDL 9010胞外多糖合成蛋白cpsB的结构特性，该文通过生物信息学技术研究了胞外多糖合成蛋白cpsB的理化性质、亲/疏水性、跨膜结构、功能位点、磷酸化位点、信号肽、结构域、保守功能域、序列同源性以及空间结构进行预测与分析。结果表明胞外多糖合成蛋白cpsB相对分子质量约为2 920，等电点6.86，含有191个氨基酸；其为疏水蛋白，具有较高的稳定性；经过跨膜结构预测，发现其不存在跨膜结构，为胞内蛋白；胞外多糖合成蛋白cpsB中含有15个磷酸位点；氨基酸序列中不包含信号肽，所编码蛋白均为内分泌型蛋白；保守功能域预测中，基因中仅发现一段PHP结构域，该基因可能参与调节胞外多糖的基因表达。胞外多糖合成蛋白cpsB的二级结构中α-螺旋占51.14%，并不存在β-折叠和β-转角结构，其三级结构比例与二级结构基本相似。该研究对植物乳杆菌DMDL 9010的胞外多糖合成蛋白cpsB功能机制进行深入研究，对利用基因工程技术研究其胞外多糖的生物合成具有重要意义。
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| 关 键 词： | 植物乳杆菌 胞外多糖合成蛋白cpsB 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2023/3/2 0:00:00 |
Bioinformatics Analysis of Capsular Polysaccharide Synthesis Protein cpsB Prepared by Using Lactiplantibacillus plantarum DMDL 9010 |
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| LIANG Wanshi,WU Jiamin,LIN Jiawei,CAO Kai,SONG Weitong,ZENG Xin''an,LIU Dongmei,HUANG Yanyan.Bioinformatics Analysis of Capsular Polysaccharide Synthesis Protein cpsB Prepared by Using Lactiplantibacillus plantarum DMDL 9010[J].Modern Food Science & Technology,2024,40(3):113-120. |
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| Authors: | LIANG Wanshi WU Jiamin LIN Jiawei CAO Kai SONG Weitong ZENG Xin'an LIU Dongmei HUANG Yanyan |
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| Affiliation: | (1.School of Food Science and Engineering, Guangdong Provincial Key Laboratory of Intelligent Food Anufacturing, Foshan University of Science and Technology, Foshan 528225, China);(1.School of Food Science and Engineering, Guangdong Provincial Key Laboratory of Intelligent Food Anufacturing, Foshan University of Science and Technology, Foshan 528225, China) (2.School of Food Science and Engineering, South China University of Technology, Guangzhou 510640, China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Lactiplantibacillus plantarum capsular polysaccharide synthesis protein cpsB bioinformatics |
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