| 基于进化保守性的蛋白质相互作用位点预测 |
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| 引用本文： | 程节华,程家兴,杜秀全.基于进化保守性的蛋白质相互作用位点预测[J].计算机工程与设计,2011,32(5):1833-1836. |
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| 作者姓名： | 程节华 程家兴 杜秀全 |
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| 作者单位： | 1. 安徽大学,计算智能与信号处理教育部重点实验室,安徽,合肥,230039;安徽科技学院,计算机系,安徽,凤阳,233100
2. 安徽大学,计算智能与信号处理教育部重点实验室,安徽,合肥,230039 |
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| 基金项目： | 安徽省高校自然科学研究基金 |
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| 摘 要： | 为了从蛋白质结构数据库中提取经验知识,进行蛋白质作用位点预测,提出了以蛋白质序列谱作为特征向量,采用支持向量机算法进行训练和预测蛋白质相互作用位点的方法。从蛋白质一级序列出发,以序列上邻近残基的序列谱为输入特征向量,采用支持向量机方法构建预测器,来预测蛋白质相互作用位点,预测精度达到70.47%,相关系数CC=0.1919。实验结果表明,利用蛋白质序列谱,结合支持向量机算法进行蛋白质相互作用位点预测的方法是有效的。
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| 关 键 词： | 蛋白质相互作用位点 进化保守性 序列谱 支持向量机 蛋白质结构数据库 |
Prediction of protein interaction sites using information of evolutionary conservation |
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| CHENG Jie-hua,CHENG Jia-xing,DU Xiu-quan.Prediction of protein interaction sites using information of evolutionary conservation[J].Computer Engineering and Design,2011,32(5):1833-1836. |
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| Authors: | CHENG Jie-hua CHENG Jia-xing DU Xiu-quan |
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| Affiliation: | 1(1.Key Laboratory of Intelligent Computing and Signal Processing,Ministry of Education,Anhui University,Hefei 230039,China;2.Department of Computer,Anhui Science and Technology University,Fengyang 233100,China) |
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| Abstract: | |
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