| 基于残基-水作用网络的木聚糖酶耐热性研究 |
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| 引用本文： | 饶榕,丁彦蕊. 基于残基-水作用网络的木聚糖酶耐热性研究[J]. 食品与生物技术学报, 2019, 38(9): 78-84 |
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| 作者姓名： | 饶榕 丁彦蕊 |
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| 作者单位： | 江南大学 物联网工程学院,江苏 无锡 214122,江南大学 数字媒体学院,江苏 无锡214122; 江南大学 工业生物技术教育部重点实验室,江苏 无锡 214122 |
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| 摘 要： | 水在蛋白质折叠、相互作用、分子识别、动力学及耐热性方面发挥着重要作用。利用Voronoi算法识别出与耐热和常温木聚糖酶存在相互作用的水。以氨基酸残基和水为节点,残基-残基及残基-水相互作用为边,构建残基-水相互作用网络。计算网络中节点的度、聚类系数、接近中心性和节点中心性,发现水的这些参数均与木聚糖酶耐热性成正相关关系。耐热木聚糖酶中度为2的hub水数量要比常温酶多,可见水在耐热木聚糖酶中参与了更多的相互作用。以度为2的水为聚类中心,以氨基酸残基节点的度18为阈值进行聚类。子网表明hub水多与hub残基聚为一类,即网络存在富人俱乐部现象。这表明,水不仅参与了耐热木聚糖酶的残基-水相互作用,还加强了残基-残基相互作用,更有利于酶形成稳定的结构来抵御高温。
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| 关 键 词： | 残基-水相互作用网络 网络拓扑特征 网络聚类 木聚糖酶热稳定性 |
Research of Xylanase Thermostability Based on Residue-Water Interaction Network |
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| RAO Rong and DING Yanrui. Research of Xylanase Thermostability Based on Residue-Water Interaction Network[J]. Journal of Food Science and Biotechnology, 2019, 38(9): 78-84 |
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| Authors: | RAO Rong and DING Yanrui |
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