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单增李斯特菌感染RAW264.7细胞转录组差异表达分析
引用本文:马红梅,马臣杰,岳苑,马玲玲,马嘉琦,曾瑾. 单增李斯特菌感染RAW264.7细胞转录组差异表达分析[J]. 食品与生物技术学报, 2023, 42(6): 38-48
作者姓名:马红梅  马臣杰  岳苑  马玲玲  马嘉琦  曾瑾
作者单位:宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室,宁夏 银川 750021;宁夏大学 生命科学学院,宁夏 银川 750021;宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室,宁夏 银川 750021;宁夏大学 生命科学学院,宁夏 银川 750021;宁夏回族自治区食品检测研究院,宁夏 银川 750002
摘    要:为了探讨单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,LM)感染前后RAW264.7细胞基因表达谱变化,筛选关键功能基因和通路,为探究其致病机制奠定基础,本研究以感染复数(MOI)10的LM 感染RAW264.7细胞6 h后,提取细胞RNA进行转录组测序,选取感染组与对照组相比差异倍数≥1.5且P<0.05的差异表达基因进行GO和KEGG富集分析,并通过RT-qPCR验证部分差异基因。转录组结果显示RAW264.7细胞在感染LM前后有1 782 个基因差异表达,其中上调为989,下调为793。GO分析结果主要涉及免疫系统过程、免疫反应、细胞程序性死亡调控等。KEGG分析结果显示,显著富集的通路有细胞因子-受体相互作用、肿瘤坏死因子信号通路、IL-17信号通路等。RT-qPCR验证试验结果显示,随机选择的11 个显著差异基因表达倍数趋势与测序结果一致。该研究为进一步深入研究LM的致病机制奠定了基础。

关 键 词:单核细胞增生李斯特菌;RAW264.7细胞;转录组;差异表达基因

Comparative Analysis of Transcriptome Differential Expression in RAW264.7 Cells Infected by Listeria monocytogenes
MA Hongmei,MA Chenjie,YUE Yuan,MA Lingling,MA Jiaqi,ZENG Jin. Comparative Analysis of Transcriptome Differential Expression in RAW264.7 Cells Infected by Listeria monocytogenes[J]. Journal of Food Science and Biotechnology, 2023, 42(6): 38-48
Authors:MA Hongmei  MA Chenjie  YUE Yuan  MA Lingling  MA Jiaqi  ZENG Jin
Affiliation:Key Laboratory of Ministry of Education for Conservation and Utilization of Special Biological Resources in the Western, Ningxia University, Yinchuan, Ningxia 750021, China;College of Life Science, Ningxia University, Yinchuan, Ningxia 750021, China;Key Laboratory of Ministry of Education for Conservation and Utilization of Special Biological Resources in the Western, Ningxia University, Yinchuan, Ningxia 750021, China; College of Life Science, Ningxia University, Yinchuan, Ningxia 750021, China;Ningxia Hui Autonomous Region Food Testing and Research Institute, Yinchuan 750002, China
Abstract:
Keywords:
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