| 电子细胞模型Analog-Cell中基因表达调控的模拟实现 |
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| 引用本文： | 韩霄松, 裴志利, 卢欣华, 纪兆华, 梁艳春. 电子细胞模型Analog-Cell中基因表达调控的模拟实现[J]. 计算机研究与发展, 2011, 48(2): 195-202. |
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| 作者姓名： | 韩霄松 裴志利 卢欣华 纪兆华 梁艳春 |
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| 作者单位： | 1(吉林大学计算机科学与技术学院 长春 130012) 2(符号计算与知识工程教育部重点实验室(吉林大学) 长春 130012) 3(吉林大学数学学院 长春 130012) 4(内蒙古民族大学计算机科学与技术学院 内蒙古通辽 028043) (squarlhan@gmail.com) |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目,国家"八六三"高技术研究发展计划基金项目,内蒙古自治区自然科学基金项目,内蒙古民族大学博士科研启动基金项目 |
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| 摘 要： | 电子细胞模型的研究是人工生命的重要研究领域之一,Analog-Cell是国内第1个电子细胞图形模型,用于在分子水平上图形化的模拟真核细胞的基因表达过程.扩展的Analog-Cell添加了在基因表达过程中起重要作用的酶和调控因子,利用状态控制机制,设计并实现了转录、mRNA的加工和翻译3个阶段中基因表达调控的主要反应的算法,并结合模拟示例展示了这些算法的运行结果.模拟实验结果表明,设计的算法符合生物学原理,使Analog-Cell具备了一定的图形化模拟基因表达调控反应的能力.最后,指出了上述工作给Analog-Cell带来的新优势,并对下一步工作进行了展望.
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| 关 键 词： | 生物信息学 人工生命 电子细胞 基因表达 基因表达调控 |
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