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双瓶选择饮酒致酒精依赖小鼠海马中长链非编码RNA的表达谱分析
引用本文:薛琳媛,武南南,封芮芮,赵欣,张宇,殷丽天.双瓶选择饮酒致酒精依赖小鼠海马中长链非编码RNA的表达谱分析[J].粉末涂料与涂装,2024(5):559-565.
作者姓名:薛琳媛  武南南  封芮芮  赵欣  张宇  殷丽天
作者单位:山西医科大学基础医学院生理学系细胞生理学教育部重点实验室
基金项目:国家自然科学基金(81601167);;山西省回国留学人员科研资助项目(2020-080);
摘    要:目的 对双瓶选择饮酒致酒精依赖小鼠海马中的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表达谱进行分析。方法 通过双瓶选择饮酒法建立酒精依赖小鼠模型,同时设对照组(饮水)。选取酒精组酒精偏好率> 60%且酒精饮用量> 10 g/(kg·24 h)的雄性小鼠3只,随机抽取对照组雄性小鼠3只,分离双侧海马脑组织,液氮保存。采用Agilent084388芯片对小鼠海马脑组织RNA样本lncRNA和mRNA进行测序分析,lncRNA表达谱芯片(ncRNA microarray)检测样本中lncRNA的差异表达情况。基因功能(Gene Ontology,GO)和信号通路数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析差异表达lncRNA可能涉及的生物学过程及参与的信号通路。Pearson相关分析预测与每个差异表达lncRNA共表达的编码基因,超几何分布检验法计算每个对应转录因子条目中差异基因富集的显著性,Cytoscape软件绘制可视化网络图。结果 与对照组比较,酒精组小鼠海马组织差异表达的lncRN...

关 键 词:长链非编码RNA  酒精依赖  海马  双瓶选择饮酒  基因芯片
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