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基于DGGE分析的大鼠粪便及肠道细菌DNA提取方法研究
引用本文:郑刚,陈己任,胡博文,陈彦斌,赵国华. 基于DGGE分析的大鼠粪便及肠道细菌DNA提取方法研究[J]. 食品科学, 2011, 32(17): 215. DOI: 10.7506/spkx1002-6630-201117044
作者姓名:郑刚  陈己任  胡博文  陈彦斌  赵国华
作者单位:西南大学食品科学学院;湖南农业大学园艺园林学院;重庆市农产品加工技术重点实验室;
基金项目:国家“863”计划项目(2011AA100805); 新疆生产建设兵团博士基金项目(2009JC12); 国家自然科学基金项目(31071826)
摘    要:为获得高质量肠道细菌总DNA用于研究膳食纤维对大鼠肠道菌群的影响,本实验以SD大鼠为实验动物,灌胃番茄皮膳食纤维,收集大鼠粪便及盲肠,-70℃冰箱保存。分别采用Tiangen细菌基因组试剂盒法、蛋白酶K-十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法和溶菌酶法提取粪便和肠道中的细菌总DNA,通过琼脂糖凝胶电泳、细菌通用引物PCR扩增和变性梯度凝胶电泳(DGGE)对提取效果进行观察比较,发现将溶菌酶法进行改进后,可以获得满意效果。改进后的溶菌酶法与另外两种方法比较,具有成本低、时间短、DNA得率高和多样性好等特点;该方法获得的DNA样品适合于用DGGE技术分析大鼠粪便及肠道菌群。

关 键 词:DNA提取  大鼠  粪便  肠道菌群  DGGE电泳  

Genomic DNA Extraction from Rat Faecal and Intestinal Microflora Based on DGGE Analysis
ZHENG Gang,CHEN Ji-ren,HU Bo-wen,CHEN Yan-bin,ZHAO Guo-hua. Genomic DNA Extraction from Rat Faecal and Intestinal Microflora Based on DGGE Analysis[J]. Food Science, 2011, 32(17): 215. DOI: 10.7506/spkx1002-6630-201117044
Authors:ZHENG Gang  CHEN Ji-ren  HU Bo-wen  CHEN Yan-bin  ZHAO Guo-hua
Affiliation:ZHENG Gang1,CHEN Ji-ren2,HU Bo-wen2,CHEN Yan-bin2,ZHAO Guo-hua1,3,(1.College of Food Science,Southwest University,Chongqing 400715,China,2.College of Horticulture and Gardening,Hunan Agricultural University,Changsha 410128,3.Chongqing Key Laboratory of Agricultural Products Processing,China)
Abstract:
Keywords:DNA extraction  rat  faecal  intestinal microflora  denaturing gradient gel electrophoresis(DGGE)  
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