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Analog-Cell电子细胞模型中基于并发约束的随机模型构架
引用本文:卢欣华,孙吉贵,行荣,韩霄松. Analog-Cell电子细胞模型中基于并发约束的随机模型构架[J]. 计算机科学, 2008, 35(12): 183-186
作者姓名:卢欣华  孙吉贵  行荣  韩霄松
作者单位:吉林大学计算机科学与技术学院,符号计算与知识工程教育部重点实验室,长春,130012;吉林大学计算机科学与技术学院,符号计算与知识工程教育部重点实验室,长春,130012;吉林大学计算机科学与技术学院,符号计算与知识工程教育部重点实验室,长春,130012;吉林大学计算机科学与技术学院,符号计算与知识工程教育部重点实验室,长春,130012
基金项目:国家自然科学基金重大项目,国家自然科学基金,教育部高等学校博士学科点专项科研基金,吉林省科技发展计划重大基金项目,吉林省杰出青年基金资助项目
摘    要:提出了一种在电子细胞模型中基于并发约束的随机模型架构方法,应用该架构建立了模拟基因表达过程的电子细胞模型Analog-Cell.模拟结果表明Analog-Cell这种基于并发约束的随机模型构架能更准确地反映出生物系统的真实性,相比其他电子细胞模型含有更丰富的图像信息,能更清晰地观察细胞内基因表达的全过程,具有良好的应用前景.

关 键 词:电子细胞  并发约束  随机模型  生物信息学

Architecture of Stochastic Model Based on Concurrent Constraint in Analog-Cell
LU Xin-hua,SUN Ji-gui,XING Rong,HAN Xiao-song. Architecture of Stochastic Model Based on Concurrent Constraint in Analog-Cell[J]. Computer Science, 2008, 35(12): 183-186
Authors:LU Xin-hua  SUN Ji-gui  XING Rong  HAN Xiao-song
Affiliation:LU Xin-hua SUN Ji-gui XING Rong HAN Xiao-song(College of Computer Science , Technology,Key Laboratory of Symbolic Computation , Knowledge Engineeringof Ministry of Education,Jilin University,Changchun 130012,China)
Abstract:This paper proposed a new architecture of stochastic model based on concurrent constraint in electronic cell (E-Cell),and built an E-Cell model to simulate gene expression by applying this architecture,Analog-Cell.The simulative results indicate that Analog-Cell can reflect the facility of biologic systems more accurately.Compared with other E-Cell models,Analog-Cell has the more abundant picture information,observes the whole process of gene expression in the cell more clearly and has a good prospect of ap...
Keywords:Eelectronic cell (E-Cell)  Concurrent constraint  Stochastic model  Bioinformatics  
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