| 应用单细胞rDNA序列测定方法鉴定不同生活史阶段的亚历山大藻 |
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| 引用本文： | 唐祥海,于仁成,张清春,王云峰,颜天,周名江.应用单细胞rDNA序列测定方法鉴定不同生活史阶段的亚历山大藻[J].高技术通讯,2009,19(12). |
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| 作者姓名： | 唐祥海 于仁成 张清春 王云峰 颜天 周名江 |
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| 作者单位： | 1. 中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室,青岛,266071;中国科学院研究生院,北京,100039
2. 中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室,青岛,266071 |
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| 基金项目： | 863计划，中国科学院知识创新工程重要方向性项目 |
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| 摘 要： | 通过实验室内诱导产生了重要的赤潮原因种链状亚历山大藻(Alexandrium catenella)不同生活史阶段的藻细胞,建立了低渗(TE缓冲液)溶胀和蛋白酶K处理相结合的细胞裂解方法和单细胞PCR扩增方法.应用所建立的方法,测定了不同生活史阶段的亚历山大藻细胞核糖体DNA(rDNA)两个高变区域(5.8S rDNA及其两侧的内转录间隔区和28S rDNA 5'端D1-D2区)的序列信息.结果显示,各生活史阶段的藻细胞rDNA序列在所测的两个高变区域完全相同,依据序列信息可以对处于不同生活史阶段的亚历山大藻进行鉴定.同时发现,在单个藻细胞中,两个所测片段均存有若干个多态位点,表明藻细胞内rDNA序列的多个拷贝之间可能存有差异.实验表明,对处于不同生活史阶段的赤潮原因种,通过单细胞rDNA序列测定的方法也可以进行准确鉴定.
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| 关 键 词： | 赤潮 亚历山大藻 单细胞PCR 生活史 |
Application of single-cell rDNA sequence analysis in identification of Alexandrium cells at various life stages |
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| Tang Xianghai,Yu Rencheng,Zhang Qingchun,Wang Yunfeng,Yan Tian,Zhou Mingjiang.Application of single-cell rDNA sequence analysis in identification of Alexandrium cells at various life stages[J].High Technology Letters,2009,19(12). |
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| Authors: | Tang Xianghai Yu Rencheng Zhang Qingchun Wang Yunfeng Yan Tian Zhou Mingjiang |
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| Affiliation: | Tang Xianghai~(***),Yu Rencheng~*,Zhang Qingchun~*,Wang Yunfeng~*,Yan Tian~*,Zhou Mingjiang~* ( * Key Laboratory of Marine Ecology and Environmental Science,Institute of Oceanology,Chinese Academy of Sciences,Qingdao 266071 ) ( ** Graduate School,Beijing 100039) |
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| Abstract: | Alexandrium catenella, an important HAB-causative species, was used to test the feasibility of a single-cell ribosomal DNA (rDNA) sequence analytical method in identification of target algal cells, particularly at various life stages. Alexandrium cells at various life stages were induced and examined in the laboratory and the DNA template for PCR amplification was prepared from a single cell of A. catenella using the combination of low-osmotic TE buffer and proteinase K treatment. Two high diverse regions o... |
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| Keywords: | rDNA harmful algal bloom Alexandrium single-cell PCR rDNA life history |
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