| 基于高通量测序分析年糕菌群结构和优势菌属 |
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| 引用本文： | 蔡怀依,李勇勇,娄永江,雷丽萍. 基于高通量测序分析年糕菌群结构和优势菌属[J]. 中国粮油学报, 2018, 33(8): 118 |
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| 作者姓名： | 蔡怀依 李勇勇 娄永江 雷丽萍 |
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| 作者单位： | 宁波大学海洋学院 |
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| 摘 要： | 结合宏基因组DNA进行高通量测序,分析新鲜年糕菌群结构和优势菌属。使用Usearch等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(OTU)数量,分析内生细菌的丰度和α-多样性,获得了用于分析的有效序列25 896条,OTU数为81。稀释曲线表明测序深度充分,OTU数量接近于饱和。年糕样品的Chao1指数为90.23,Shannon多样性指数为1.80。基于OTU的物种分类分析,年糕内生细菌种类覆盖29个属8个纲5个门,其中年糕内生细菌优势菌属为玫瑰色半光合菌属(Roseateles,36.75%)、芽胞杆菌属(Bacillus,24.38%)、寡养单胞菌属(Stenotrophomonas,9.36%)。
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| 关 键 词： | 高通量测序 年糕 菌群结构 优势菌属 |
| 收稿时间： | 2017-11-29 |
| 修稿时间： | 2018-03-08 |
Analysis of structural changes of spoilage bacteria and dominant spoilage bacteria of rice pastry based on high throughput sequencing technology |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | high throughput sequencing rice pastry Flora structure dominant bacteria |
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