| 融合遗传算法与XGBoost的玉米百粒重相关基因挖掘 |
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| 引用本文： | 杨帅,郭茂祖,赵玲玲,李阳. 融合遗传算法与XGBoost的玉米百粒重相关基因挖掘[J]. 智能系统学报, 2022, 17(1): 170-180. DOI: 10.11992/tis.202105005 |
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| 作者姓名： | 杨帅 郭茂祖 赵玲玲 李阳 |
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| 作者单位： | 1. 北京建筑大学 电气与信息工程学院，北京 100044;2. 建筑大数据智能处理方法研究北京市重点实验室，北京 100044;3. 哈尔滨工业大学 计算机科学与技术学院，黑龙江 哈尔滨 150001 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(62031003,61871020);北京市属高校高水平创新团队建设计划项目(IDHT20190506);国家重点研发计划子课题(2020YFF0305501);北京市教委科技计划重点项目(KZ201810016019). |
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| 摘 要： | 基于RNA-Seq的转录组测序数据特征维度较高,使用传统生信方法寻找表型相关基因需要大量计算资源,且差异分析所得候选基因范围较大,进一步筛选依赖已有的先验知识.针对这一问题,本文提出了融合遗传算法和XGBoost的转录组分析方法—GA-XGBoost,通过融入机器学习算法缩小了后续分析的候选基因范围.在一组高质量玉米数...
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| 关 键 词： | 遗传算法 极限梯度提升算法 机器学习 玉米 转录组分析 百粒重 基因本体 京都基因与基因组百科全书 |
The method of 100-kernel weight related genes mining in maize mixed with genetic algorithm and XGboost |
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| YANG Shuai,GUO Maozu,ZHAO Lingling,LI Yang. The method of 100-kernel weight related genes mining in maize mixed with genetic algorithm and XGboost[J]. CAAL Transactions on Intelligent Systems, 2022, 17(1): 170-180. DOI: 10.11992/tis.202105005 |
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| Authors: | YANG Shuai GUO Maozu ZHAO Lingling LI Yang |
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| Affiliation: | 1. School of Electrical and Information Engineering, Beijing University of Civil Engineering and Architecture, Beijing 100044, China;2. Beijing Key Laboratory of Intelligent Processing for Building Big Data, Beijing 100044, China;3. School of Computer Science and Technology, Harbin Institute of Technology, Harbin 150001, China |
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| Abstract: | |
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