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用氨基酸组分预测含顺式肽键蛋白质
作者姓名:
宋江宁 李炜疆
摘 要:
以含有820个蛋白质结构数据的SLCTBASE数据库作为样本库,根据蛋白质序列氨基酸百分含量与顺式肽键的关联信息,构建了基于序列整体氨基酸含量的顺式构象势函数.利用此函数拟合得出的20种氨基酸的顺式构象因子值,进行两类蛋白质序列的分类和预测.训练集和测试集相同时和不相同时的预测准确率分别可达66%和64%。
关 键 词:
氨基酸 顺式肽键 蛋白质序列 分类 统计预测分析方法 顺式构象势函数
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