| 基于支持向量机的蛋白质相互作用位点预测 |
| |
| 引用本文： | 王菲露,宋杰,王池社,杜秀全.基于支持向量机的蛋白质相互作用位点预测[J].计算机技术与发展,2008,18(10). |
| |
| 作者姓名： | 王菲露 宋杰 王池社 杜秀全 |
| |
| 作者单位： | 1. 安徽大学,计算智能与信号处理教育部重点实验室,安徽,合肥,230039;安徽建筑工业学院,电子与信息工程学院,安徽,合肥,230601
2. 安徽大学,计算智能与信号处理教育部重点实验室,安徽,合肥,230039 |
| |
| 基金项目： | 安徽省自然科学基金，安徽建筑工业学院校科研和教改项目，安徽省高校科研项目 |
| |
| 摘 要： | 蛋白质的功能常体现在生物大分子的相互作用中,识别蛋白质相互作用位点对于研究蛋白质功能发挥着重要作用.蛋白质问主要通过表面残基发生相互作用,蛋白质相互作用形成复合体时,只有部分表面残基参与了该过程.基于序列谱信息,提取序列上相邻残基的序列谱作为输入特征向量,对大小为3和7的残基信息窗(win3,win7),分别采用支持向量机(SVM)分类器对蛋白质相互作用位点进行预测、比较和分析.最终实验结果为:win3的平均正确率为69.31%,win7的平均正确率为69.68%.
|
| 关 键 词： | 蛋白质相互作用 序列谱 残基信息窗 支持向量机 |
Prediction of Protein-Protein Interaction Sites with SVM |
| |
| WANG Fei-lu,SONG Jie,WANG Chi-she,DU Xiu-quan.Prediction of Protein-Protein Interaction Sites with SVM[J].Computer Technology and Development,2008,18(10). |
| |
| Authors: | WANG Fei-lu SONG Jie WANG Chi-she DU Xiu-quan |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录！ |
|
