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空肠弯曲菌分离株ERIC-PCR分型和生化分型的比较研究
作者姓名:郑扬云  吴清平  吴克刚  吴葵  张菊梅
作者单位:广东工业大学轻工化工学院;广东省微生物研究所,广东省华南应用微生物重点实验室—省部共建国家重点实验室培育基地,广东省菌种保藏与应用重点实验室,广东省微生物应用新技术公共实验室;中国科学院南海海洋研究所
基金项目:国家国际科技合作专项(2013DFH30070);广东省教育部产学研结合项目(2012B090400017)
摘    要:建立空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni)的ERIC-PCR分子生物学分型技术,比较ERIC-PCR分型和生化分型的分型效果。从菌株TY1273出发,运用L16(54)正交试验,对Mg2+、dNTPs、引物和TaqDNA聚合酶浓度等因素在较大范围水平内进行反应体系条件摸索,得到一个初步的优化体系;在此基础之上进行单因素的进一步小范围水平内的微调优化,得到最终的优化体系;最后以优化的ERIC-PCR方法对24株C.jejuni分离株分型;同时根据API Campy生化反应结果进行生化分型,比较ERIC-PCR分子分型方法和生化分型方法。结果显示ERIC-PCR方法将24株菌扩增均得到大小在100 bp-3000 bp之间的条带,并可将其分为22个基因型,分辨系数为0.92,具有较高的分辨力。生化分型将24株菌分为19个生化型,显示了菌株基因的多样性。表明ERIC-PCR技术比生化分型能更好的体现菌株的遗传多样性,且具有简便和分辨力搞等优点,可用于C.jejuni的多样性研究。

关 键 词:空肠弯曲菌  ERIC-PCR  分子分型  生化分型
收稿时间:2013-05-15
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