空肠弯曲菌分离株ERIC-PCR分型和生化分型的比较研究 |
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作者姓名: | 郑扬云 吴清平 吴克刚 吴葵 张菊梅 |
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作者单位: | 广东工业大学轻工化工学院;广东省微生物研究所,广东省华南应用微生物重点实验室—省部共建国家重点实验室培育基地,广东省菌种保藏与应用重点实验室,广东省微生物应用新技术公共实验室;中国科学院南海海洋研究所 |
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基金项目: | 国家国际科技合作专项(2013DFH30070);广东省教育部产学研结合项目(2012B090400017) |
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摘 要: | 建立空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni)的ERIC-PCR分子生物学分型技术,比较ERIC-PCR分型和生化分型的分型效果。从菌株TY1273出发,运用L16(54)正交试验,对Mg2+、dNTPs、引物和TaqDNA聚合酶浓度等因素在较大范围水平内进行反应体系条件摸索,得到一个初步的优化体系;在此基础之上进行单因素的进一步小范围水平内的微调优化,得到最终的优化体系;最后以优化的ERIC-PCR方法对24株C.jejuni分离株分型;同时根据API Campy生化反应结果进行生化分型,比较ERIC-PCR分子分型方法和生化分型方法。结果显示ERIC-PCR方法将24株菌扩增均得到大小在100 bp-3000 bp之间的条带,并可将其分为22个基因型,分辨系数为0.92,具有较高的分辨力。生化分型将24株菌分为19个生化型,显示了菌株基因的多样性。表明ERIC-PCR技术比生化分型能更好的体现菌株的遗传多样性,且具有简便和分辨力搞等优点,可用于C.jejuni的多样性研究。
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关 键 词: | 空肠弯曲菌 ERIC-PCR 分子分型 生化分型 |
收稿时间: | 2013-05-15 |
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