| 新抗菌肽设计及活性与功能预测 |
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| 引用本文： | 杨丽敏,黄燕,张日俊.新抗菌肽设计及活性与功能预测[J].计算机与现代化,2013(2):138-142. |
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| 作者姓名： | 杨丽敏 黄燕 张日俊 |
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| 作者单位： | 中国农业大学信息与电气工程学院;中国农业大学饲料生物技术实验室动物营养学国家重点实验室 |
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| 基金项目： | 高等学校博士学科点专项科研基金资助项目(20110008110002);国家自然科学基金资助项目(31272476) |
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| 摘 要： | 通过对影响抗菌肽活性因子的分析,确定可量化的因子参数,并对已有抗菌肽的活性因子数据进行统计分析,得到参数取值范围。采用Java技术,对已有抗菌肽序列进行剪切拼接,得到新肽。根据参数取值范围判断新肽,是否有活性,并进行功能预测,同时对抗菌肽构建三维空间结构图。分析证明,亲水端正电荷量是四类抗菌肽具有抗菌活性的重要共性;疏水氨基酸残基百分比和α-螺旋百分比两因子对区分四类抗菌肽功能效果显著。
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| 关 键 词： | α-螺旋 活性因子 活性预测 功能预测 抗菌肽 3D结构 |
Design of New Antimicrobial Peptides and Prediction of Its Activity and Function |
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| YANG Li-min,HUANG Yan,ZHANG Ri-jun.Design of New Antimicrobial Peptides and Prediction of Its Activity and Function[J].Computer and Modernization,2013(2):138-142. |
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| Authors: | YANG Li-min HUANG Yan ZHANG Ri-jun |
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| Affiliation: | 1.College of Information and Electrical Engineering,China Agricultural University,Beijing 100083,China; 2.Laboratory of Feed Biotechnology,State Key Lab.of Animal Nutrition,China Agricultural University,Beijing 100083,China) |
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