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生物信息学中的序列比对算法
作者单位:南昌航空大学计算机学院 江西南昌330063(张永),江西大宇职业技术学院 江西南昌330038(王瑞)
摘    要:生物信息学是以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。序列比对是生物信息学中的一个基本问题,设计快速而有效的序列比对算法是生物信息学研究的一个重要内容,通过序列比较可以发现生物序列中的功能、结构和进化的信息,序列比较的基本操作是比对。本文介绍了序列比对算法的发展现状,描述了常用的各类序列比对算法,并分析了它们的优劣。

关 键 词:生物信息学  双序列比对  多序列比对

Sequence Alignment Algorithms in Bioinformatics
ZHANG Yong,WANG Rui. Sequence Alignment Algorithms in Bioinformatics[J]. Digital Community & Smart Home, 2008, 0(1)
Authors:ZHANG Yong  WANG Rui
Affiliation:ZHANG Yong1,WANG Rui2
Abstract:Bioinformatics is the subject of using computer to store,retrieve and analyze biological information. Sequence alignment is a basic problem in Bioinformatics,and its main research work is to develop rapid and effective sequence alignment algorithms. We may discover functional,structural and evolutionary information in biological sequences by sequence comparing. This paper introduces the development actuality of sequence alignment algorithms,describes variety of sequence alignment algorithm and analyses the advantages and disadvantages of them.
Keywords:Bioinformatics  Pairwise Sequence Alignment  Multiple Sequence Alignment
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