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肝癌靶点的筛选与验证
引用本文:王丽萍,田振波,唐旭清.肝癌靶点的筛选与验证[J].数据采集与处理,2021,36(4):664-674.
作者姓名:王丽萍  田振波  唐旭清
作者单位:江南大学理学院,无锡 214122
基金项目:国家自然科学基金(11371174)资助项目。
摘    要:肝癌是临床上具有高致死率的常见恶性肿瘤之一,发现新靶点、开发新药对于疾病的治疗至关重要。本文从生物功能和网络的角度分析了与肝癌发生、发展相关的差异表达基因,旨在筛选出肝癌早期诊断的分子标志物和免疫治疗靶点。首先对两组肝癌相关基因表达数据进行差异表达筛选;然后通过GO(Gene ontology)功能和KEGG(The kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路分析,得到同时在主要功能和信号通路上显著富集的128个目标基因;最后通过基因调控网络探讨目标基因的相互作用规律,找出10个关键基因并进行生存分析验证。结果表明,得到的CYP3A4、CYP3A5、CYP2C9和CYP2C8这4个基因适合作为肝癌标志物或靶向治疗靶点。本文为肝癌发生、发展的机制研究,肿瘤标志物的筛选及药物靶点选择提供了参考,为进一步开展相关的功能研究提供了基础。

关 键 词:肝癌  基因调控网络  生存分析  靶点筛选  靶点验证
收稿时间:2020/8/11 0:00:00
修稿时间:2020/10/28 0:00:00

Screening and Verification of Liver Cancer Targets
WANG Liping,TIAN Zhenbo,TANG Xuqing.Screening and Verification of Liver Cancer Targets[J].Journal of Data Acquisition & Processing,2021,36(4):664-674.
Authors:WANG Liping  TIAN Zhenbo  TANG Xuqing
Affiliation:School of Science, Jiangnan University, Wuxi 214122, China
Abstract:
Keywords:liver cancer  gene regulatory network  survival analysis  target screening  target verification
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