| COBRA框架在转录调控、转录翻译和信号传导网络上的应用研究 |
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| 引用本文： | 王英.COBRA框架在转录调控、转录翻译和信号传导网络上的应用研究[J].计算机应用与软件,2011,28(11). |
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| 作者姓名： | 王英 |
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| 作者单位： | 复旦大学计算机科学与技术学院 上海200433上海市智能信息处理重点实验室 上海200433 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(61073068); 复旦大学“学生学术科技创新行动支持计划”(第二十三期) |
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| 摘 要： | 转录调控、转录翻译和信号传导网络等生化网络分别刻画不同的生物过程,描述细胞的不同生命活动。对这些生化网络进行计算机建模与分析,不仅可以获得细胞生长各阶段更加全面的认识,同时对药物靶点的确定和代谢工程的发展也有着深远的影响。基于约束的重构和分析方法COBRA是一套完整的对生化网络进行建模和分析的框架。它已被广泛应用于全基因组规模代谢网络的研究中,同时在应用过程中也发展出了许多极具价值的分析方法。近年来,COBRA框架也被陆续应用到其它生化网络中。主要介绍COBRA框架在转录调控、转录翻译和信号传导网络中的建模和分析方面的应用,并且简要评述COBRA框架的研究现状及可能的发展方向。
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| 关 键 词： | COBRA 转录调控网络 转录翻译网络 信号传导网络 生物信息学 |
APPLICATION STUDY OF COBRA ON TRANSCRIPTIONAL REGULATORY NETWORK,TRANSCRIPTIONAL AND TRANSLATIONAL NETWORK,AND SIGNALING NETWORK |
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| Wang Ying.APPLICATION STUDY OF COBRA ON TRANSCRIPTIONAL REGULATORY NETWORK,TRANSCRIPTIONAL AND TRANSLATIONAL NETWORK,AND SIGNALING NETWORK[J].Computer Applications and Software,2011,28(11). |
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| Authors: | Wang Ying |
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| Affiliation: | Wang Ying (School of Computer Science,Fudan University,Shanghai 200433,China) (Shanghai Key Laboratory of Intelligent Information Processing,China) |
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