| 改进的MC_GEP算法与嘌呤骨架类Hsp90抗癌活性的定量结构活性关系研究 |
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| 引用本文： | 付伟忠,张运陶.改进的MC_GEP算法与嘌呤骨架类Hsp90抗癌活性的定量结构活性关系研究[J].计算机与应用化学,2010,27(5). |
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| 作者姓名： | 付伟忠 张运陶 |
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| 作者单位： | 西华师范大学应用化学研究所,四川,南充,637002 |
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| 摘 要： | 以35种嘌呤骨架类热休克蛋白90(Hsp90)化合物为研究对象,以文献3]的8个变量构成自变量集,提出1种改进的MC_GEP算法对该类化合物抗癌活性pEC50做定量结构活性关系研究.按文献3]对所有35种嘌呤类化合物建模,本文GEP模型与文献3]的回归模型计算结果决定系数R2分别为0.821 4和0.738 0.进一步用七均值聚类算法将此35种化合物划分为训练集和预测集,分别采用改进的MC_GEP算法、v-SVM和ε-SVM算法基于训练集建模,本文建立的GEP模型训练和预测结果R2分别为0.808 0和0.745 5,而v-SVM和ε-SVM模型对预测集的预测结果R2分别为0.204 6和0.410 3,均低于0.5.研究表明,本文提出的改进MC GEP算法函数发现能力较强,建立的QSAR模型预测性能好.
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| 关 键 词： | 热休克蛋白90 定量结构活性关系 改进MC_GEP 线性解码 |
QSAR study on antitumor activity of 35 kinds of purine derivatives with Hsp90 based on an improved MC_GEP algorithm |
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| Fu Weizhong,Zhang Yuntao.QSAR study on antitumor activity of 35 kinds of purine derivatives with Hsp90 based on an improved MC_GEP algorithm[J].Computers and Applied Chemistry,2010,27(5). |
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| Authors: | Fu Weizhong Zhang Yuntao |
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