| 基于全基因组De novo测序的异常汉逊酵母菌株792基因组重复序列的分布特征研究 |
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| 引用本文： | 王婷,张寒玉,蔡长龙,唐朝,毛培宏,钱卫东,李永东.基于全基因组De novo测序的异常汉逊酵母菌株792基因组重复序列的分布特征研究[J].西北轻工业学院学报,2018(4). |
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| 作者姓名： | 王婷 张寒玉 蔡长龙 唐朝 毛培宏 钱卫东 李永东 |
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| 作者单位： | 陕西科技大学食品与生物工程学院;新疆大学离子束生物技术中心;西安工业大学离子束生物工程与生物多样性研究中心;宁波市疾病预防控制中心 |
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| 摘 要： | 重复序列是基因组的重要组成部分,对生物的进化、遗传和基因的表达调控有重要作用.本研究利用生物信息学方法,在异常汉逊酵母菌株792全基因组de novo测序的基础上,对基因组重复序列的分布特征进行了研究.结果表明,其全基因组中重复序列总长346 417bp,其中,串联重复序列238 164bp,散在重复序列108 253bp,占基因组长度的2.52%,平均每4.05Kb就有一个重复序列.微卫星DNA序列中重复单元拷贝数大多低于15次,其优势碱基类型为三核苷酸重复,重复单元基序为AAC的微卫星序列数目最多;小卫星DNA序列重复单元拷贝数小于微卫星DNA,主要分布1~3次,重复单元大于15bp的小卫星序列数目随着重复单位长度的增加呈下降趋势.散在重复序列中长末端重复序列(LTR)数目最多,滚环(RC)平均长度最长.本研究结果为汉逊酵母菌的分子定向育种和SSR分子标记的开发提供理论基础.
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