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基于计算机辅助药物设计研究白术挥发油的主要成分作用靶点及药效预测
作者姓名:于启蒙  张新超  孟慧琴  张霖  朱德志  章伟  王爱东
作者单位:黄山学院
摘    要:[目的]基于计算机辅助药物设计(CADD)研究白术挥发油中的白术内酯Ⅰ、白术内酯Ⅱ、白术内酯Ⅲ、苍术酮、β-榄香烯、香橙烯和异香橙烯分子潜在作用靶点,并预测这7个分子的药效。[方法]查阅文献建立含有上述7个配体分子结构的分子库,使用Discovery Studio 2016(DS)软件对分子库的分子结构进行优化,运用DS中的反向找靶(Target Fishing)功能模块对含有超过117000个药效团模型的PharmaDB药效团数据库搜索;根据反向找靶的运行结果,筛选出配体与药效团的契合值(Fit value)≥0.9且对应打分最高的靶点蛋白。从PDB数据库下载靶点蛋白,运用DS中的分子对接(Molecular Docking)技术查看筛选出的配体分子与对应靶点蛋白的非键相互作用情况。[结果]反向找靶结果中筛选出6个靶点蛋白分别为酪蛋白激酶2、MDMX蛋白、维生素D3羟化酶、细胞周期蛋白A和细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶2的复合物、CDC样激酶3和酪蛋白激酶2α亚基。根据分子对接的结果并结合生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Informa...

关 键 词:白术  反向找靶  分子对接  药效预测  计算机辅助药物设计
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