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基于支持向量机的微阵列基因表达数据分析方法
引用本文:刘青,杨小涛. 基于支持向量机的微阵列基因表达数据分析方法[J]. 小型微型计算机系统, 2005, 26(3): 363-366
作者姓名:刘青  杨小涛
作者单位:1. 中国人民大学,信息学院,北京,100872;华中科技大学,计算机学院,湖北,武汉,430074
2. 华中科技大学,计算机学院,湖北,武汉,430074
摘    要:DNA微阵列技术,使人们可以同时观测成千上万个基因的表达水平,对其数据的分析已成为生物信息学研究的焦点.针对微阵列基因表达数据维数高、样本小、非线性的特点,设计了一种基于支持向量机的基因表达数据分类识别方法,该方法采用信噪比进行基因特征提取,运用支持向量机的不同核函数进行性能测试,针对几个典型数据集的实验表明其识别效果良好.

关 键 词:生物信息学 DNA微阵列 基因表达谱 支持向量机
文章编号:1000-1220(2005)03-0363-04

Microarray Gene Expression Data Anlysis Based on Support Vector Maching
LIU Qing,YANG Xiao-tao. Microarray Gene Expression Data Anlysis Based on Support Vector Maching[J]. Mini-micro Systems, 2005, 26(3): 363-366
Authors:LIU Qing  YANG Xiao-tao
Affiliation:LIU Qing~1,2,YANG Xiao-tao21
Abstract:Based on DNA microarray experiment, the expression level of thousands of genes can be observed simultaneously, and the method of the analysis is focused in bioinformatics. Because microarray gene expression data are high dimensions and few samples and nonlinear, a method of gene expression data analysis was put forward, in which the gene subset are extracted by the method of signal to noise ratio and the several kernels of support vector machine were applied to test the performances, this method has been successfully applied to several expression data sets.
Keywords:bioinformatics  DNA microarray  gene expression profile  support vector maching
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