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甲型肝炎病毒荧光定量RT-PCR检测方法的建立及在贝类检测中的应用
引用本文:袁亚迪,孙世洋,卞莲莲,崔博沛,高帆,刘佩,刘令九,毛群颖,梁争论.甲型肝炎病毒荧光定量RT-PCR检测方法的建立及在贝类检测中的应用[J].粉末涂料与涂装,2020(1):55-60,65.
作者姓名:袁亚迪  孙世洋  卞莲莲  崔博沛  高帆  刘佩  刘令九  毛群颖  梁争论
作者单位:;1.中国食品药品检定研究院肝炎病毒疫苗室;2.长春生物制品研究所有限责任公司
基金项目:贝类中致病微生物富集过程及控制技术(2017YFC1600703)
摘    要:目的建立甲型肝炎病毒(hepatitis A,HAV)荧光定量逆转录PCR(qRT-PCR)检测方法,用于贝类中HAV的检测。方法选择HAV高度保守的5’UTR区设计引物及探针,以HAV质粒为标准品,HAV活病毒为样本,建立HAV qRT-PCR检测方法;验证该方法的特异性、灵敏度、重复性、准确性及中间精密度;采用建立的方法检测HAV活病毒和贝类样本,并与我国贝类HAV检测国标方法(GB/T22287-2008法)进行比较。结果通过14对引物探针分别对HAV质粒(101~108拷贝/μL)检测结果的比较,选择灵敏度最优的Pan1引物,建立了HAV qRT-PCR检测方法(PAN法)。PAN法对CVA16、CVB3、EVA71、PV等11种RNA病毒均无阳性扩增;灵敏度达10 TCID50/mL;检测2.699~5.699 LgTCID50/mL各浓度HAV活病毒的回收率为82.9%~127.0%,单人和双人检测的变异系数分别为3.0%~7.0%和2.6%~8.4%。PAN法检测HAV活病毒的灵敏度(10 TCID50/mL)优于GB/T22287-2008法;两种方法对20份贝类样本的检测结果均为阴性,符合率为100%。结论建立的PAN法具有良好的特异性、灵敏度、准确性、重复性和中间精密度,可用于贝类样本中HAV的核酸定量快速检测。

关 键 词:甲型肝炎病毒  荧光定量RT-PCR  贝类

Development of fluorescent quantitative RT-PCR method for determination of hepatitis A virus and application in shellfish
YUAN Ya-di,SUN Shi-yang,BIAN Lian-lian,CUI Bo-pei,GAO Fan,LIU Pei,LIU Ling-jiu,MAO Qun-ying,LIANG Zheng-lun.Development of fluorescent quantitative RT-PCR method for determination of hepatitis A virus and application in shellfish[J].Chinese Journal of Biologicals,2020(1):55-60,65.
Authors:YUAN Ya-di  SUN Shi-yang  BIAN Lian-lian  CUI Bo-pei  GAO Fan  LIU Pei  LIU Ling-jiu  MAO Qun-ying  LIANG Zheng-lun
Affiliation:(Division of Hepatitis Vaccine,National Institutes for Food and Drug Control,Beijing 100050,China)
Abstract:
Keywords:Hepatitis A virus(HAV)  Fluorescent quantitative RT-PCR  Shellfish
本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录!
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