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基于DGGE和Illumina MiSeq技术解析恩施地区米酒细菌多样性
作者单位:;1.湖北文理学院食品科学技术学院鄂西北传统发酵食品研究所;2.恩施市农业局;3.恩施市公共检验检测中心
摘    要:以10个恩施地区米酒为研究对象,采用变性梯度凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)与MiSeq高通量技术对其细菌多样性进行了评价。DGGE结果表明,恩施地区米酒中的细菌主要为Weissella、Enterococcus、Pediococcus、Kosakonia和Lactobacillus。MiSeq高通量测序结果表明,米酒中的细菌属主要为隶属于Firmicutes的Pediococcus、Enterococcus、Weissella,以及隶属于Proteobacteria的Kosakonia和隶属于Bacteroidetes的Prevotella,其平均相对含量分别为58. 03%、10. 72%、8. 24%、3. 34%和2. 01%。在分类操作单元(operational taxonomic units,OTU)水平上,发现了6个核心OTU,其中OTU5646 (隶属于Pediococcus)的平均含量为54. 74%。采用传统纯培养技术共分离出17株乳酸菌,其中11株鉴定为Pediococcus pentosaceus。由此可见,Pediococcus为恩施地区米酒样品中的优势细菌。

关 键 词:米酒  细菌多样性  变性梯度凝胶电泳  MiSeq高通量测序

Bacterial community in Enshi rice wines analyzed by DGGE and Illumina MiSeq high-throughput sequencing
Abstract:
Keywords:
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