| 蛋白质-RNA对接中打分函数设计及RNA结合位点识别研究进展 |
| |
| 引用本文： | 李春华,刘洋,陆林,马梦琳,谭建军,张小轶,王存新.蛋白质-RNA对接中打分函数设计及RNA结合位点识别研究进展[J].北京工业大学学报,2017,43(12). |
| |
| 作者姓名： | 李春华 刘洋 陆林 马梦琳 谭建军 张小轶 王存新 |
| |
| 作者单位： | 北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京,100124;北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京,100124;北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京,100124;北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京,100124;北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京,100124;北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京,100124;北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京,100124 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，北京市自然科学基金资助项目 |
| |
| 摘 要： | 分子对接是目前研究蛋白质-RNA相互作用与识别的有效方法之一.其中,打分函数的合理设计与分子结合位点的准确识别对成功预测蛋白质-RNA复合物结构至关重要.结合小组的工作,对用分子对接方法预测蛋白质-RNA复合物结构中所涉及2个关键性问题(即分子对接打分函数的设计和RNA结合位点的预测)及研究进展进行了回顾,并对几种常用的方法进行了比较.最后分析了这两方面研究目前所存在的主要问题,并对未来的发展方向进行了展望.
|
| 关 键 词： | 蛋白质-RNA相互作用 分子对接 打分函数 RNA结合位点预测 |
Research Progresses on Scoring Function Design and RNA-binding Site Identification in Protein-RNA Docking |
| |
| LI Chunhua,LIU Yang,LU Lin,MA Menglin,TAN Jianjun,ZHANG Xiaoyi,WANG Cunxin.Research Progresses on Scoring Function Design and RNA-binding Site Identification in Protein-RNA Docking[J].Journal of Beijing Polytechnic University,2017,43(12). |
| |
| Authors: | LI Chunhua LIU Yang LU Lin MA Menglin TAN Jianjun ZHANG Xiaoyi WANG Cunxin |
| |
| Abstract: | Molecular docking is one of the effective methods for studying the interaction and recognition between protein and RNA. The reasonable design of scoring functions and accurate RNA-binding site identification are critical to the successful prediction of protein-RNA complex structures. In this paper, the research progresses on the two important aspects involved in protein-RNA docking study including scoring function design and RNA-binding site prediction were reviewed. And a comparison for these currently proposed methods was made. Finally, the major difficulties were analyzed in the two aspects and the development direction in the future was discussed. |
| |
| Keywords: | protein-RNA interactions molecular docking scoring function RNA-binding site prediction |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
