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| 电子细胞中前体mRNA加工过程的模拟与研究 | |
| 引用本文： | 王玉贤 卢欣华. 电子细胞中前体mRNA加工过程的模拟与研究[J]. 计算机应用, 2012, 32(1): 228-233. DOI: 10.3724/SP.J.1087.2012.00228 |
| 作者姓名： | 王玉贤 卢欣华 |
| 作者单位： | 1. 广东松山职业技术学院 计算机系，广东 韶关 5121262. 吉林大学3. 吉林大学 计算机科学与技术学院，长春 130012 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(61003101);欧盟项目基金TH/Asia Link/010资助项目(111084);吉林省科技发展计划基金资助项目(20101501);吉林省杰出青年基金资助项目(20080107, 20080617);吉林大学基本科研业务费项目—平台基地建设项目(93K172011704) |
| 摘 要： | 前体mRNA的加工是基因表达过程中必需的一个步骤，是调节基因表达和产生具有生化活性的蛋白质的重要机制，现有的电子细胞模型对前体mRNA的加工过程模拟得较少。自主开发设计的Analog-Cell电子细胞模型定义了反应过程中的反应规则，提出了模拟前体mRNA加工过程的多个算法，真实地再现了基因表达这一细胞内重要的生命活动，并得到了比较理想的模拟结果。 |
| 关 键 词： | 电子细胞 Analog-Cell mRNA 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2011-05-23 |
| 修稿时间： | 2011-07-09 |
Simulation and research on processing of pre-mRNA in electronic cell |
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| WANG Yu-xian LU Xin-hua. Simulation and research on processing of pre-mRNA in electronic cell[J]. Journal of Computer Applications, 2012, 32(1): 228-233. DOI: 10.3724/SP.J.1087.2012.00228 | |
| Authors: | WANG Yu-xian LU Xin-hua |
| Affiliation: | 1. Department of Computer Science, Guangdong Songshan Polytechnic College, Shaoguan Guangdong 512126, China 2. 3. College of Computer Science and Technology, Jilin University, Changchun Jilin 130012, China |
| Abstract: | The processing of pre-mRNA is one necessary step in gene expression, and it is an important mechanism to regulate the procedure of gene expression and produce the proteins which affect the life activities of cells. The existing electronic cell (E-Cell) models seldom relate to the simulation on the processing of pre-mRNA. The paper proposed an E-Cell model, named Analog-Cell, and reappeared realistically the procedure of gene expression through defining rational reaction rules and several algorithms which simulated the processing of pre-mRNA, thus Analog-Cell obtained recommendable simulation results. |
| Keywords: | Electronic Cell(E-Cell) Analog-Cell mRNA bioinformatics |
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