| 鲟鱼发酵过程中微生物的演替变化分析 |
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| 作者姓名： | 赵凤 李小义 张效平 杨兴 蒋晓红 |
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| 作者单位： | 贵州省农业科学研究院 水产研究所,贵州 贵阳,550025;贵州省农业科学研究院 水产研究所,贵州 贵阳,550025;贵州省农业科学研究院 水产研究所,贵州 贵阳,550025;贵州省农业科学研究院 水产研究所,贵州 贵阳,550025;贵州省农业科学研究院 水产研究所,贵州 贵阳,550025 |
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| 基金项目： | 贵州省科研机构服务企业(黔科合平台人才(2016)5714);贵州省科技支撑计划;贵州省科技支撑计划;贵州省科技支撑计划;现代农业产业技术体系建设专项;贵州特色水产产业技术体系养殖功能实验室项目;国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 为了解鲟鱼发酵中细菌群落多样性及动态演替规律,为发酵鲟鱼的品质提供理论数据,利用Illumina HiSeq测序平台,采集鲟鱼发酵过程中的7个阶段的样品,对样品中的细菌16S rDNA V4~V5区进行测序和系统发育分析。结果表明,样品获得序列数平均为46 463条,各个发酵阶段的操作分类单元数目分别为新鲜鱼样1 064,腌制鱼样952;发酵5 d 454,发酵10 d 442,发酵20 d 327,发酵25 d 372和发酵35 d 356。7组样品中总体细菌组成较为复杂,含有38个门、196个科,在新鲜鱼样中,厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)占主要优势;在腌制阶段,蓝藻门(Cyanobacteria)占主要优势;从发酵开始至结束,厚壁菌门(Firmicutes)占绝对优势。在科水平上,新鲜鱼样中的主要优势菌科为肠杆菌科(Enterobacteriaceae),腌制样品中的主要优势菌科为肠球菌科(Enterococcaceae);从发酵开始至结束,主要的优势菌科为明串珠菌科(Leuconostocaceae),其次是乳杆菌科(Lactobacillaceae)和链球菌科(Streptococceae)。通过HiSeq测序能够更全面解析鲟鱼发酵过程中的细菌多样性;从测序平台提供的微生物多样性信息中发现,各样品间的菌属丰度存在一定的差异性,说明菌群组成与发酵环境密切相关,这为传统腌鱼发酵提供了理论依据和数据支撑。
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| 关 键 词： | 鲟鱼 发酵 微生物 高通量测序 细菌群落多样性 |
Bacterial Community Succession Analysis of Fermented Sturgeon at Different Stages |
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| Authors: | ZHAO Feng LI Xiaoyi ZHANG Xiaoping YANG Xing JIANG Xiaohong |
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| Affiliation: | (Institute of fisheries,Guizhou Academy of Agricultural Sciences,Guiyang 550025,China) |
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| Abstract: | ZHAO Feng;LI Xiaoyi;ZHANG Xiaoping;YANG Xing;JIANG Xiaohong(Institute of fisheries,Guizhou Academy of Agricultural Sciences,Guiyang 550025,China) |
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| Keywords: | sturgeon fermentation microbial high-throughput sequencing bacterial community diversity |
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