| 基于GM(1,1)模型的蛋白质二级结构类型预测 |
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| 引用本文： | 林卫中,肖 绚. 基于GM(1,1)模型的蛋白质二级结构类型预测[J]. 计算机工程与应用, 2007, 43(34): 41-42 |
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| 作者姓名： | 林卫中 肖 绚 |
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| 作者单位： | 景德镇陶瓷学院,信息工程学院,江西,景德镇,333403;景德镇陶瓷学院,信息工程学院,江西,景德镇,333403 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金 , 江西省自然科学基金 |
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| 摘 要： | 蛋白质二级结构类型预测是当今生物信息学研究的热点之一。利用氨基酸数字编码模型将氨基酸序列转换成数字信号,得出此蛋白质的GM(1,1)模型参数,并将这些参数作为伪氨基酸成分,由于这些伪氨基酸成分具有描述氨基酸序列的总体特征的特点,使得预测成功率有较大的提高。
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| 关 键 词： | 蛋白质 二级结构型预测 GM(1,1)模型 |
| 文章编号： | 1002-8331(2007)34-0041-02 |
| 修稿时间： | 2007-08-01 |
Predict protein structural classes based on GM (1,1) modeling |
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| LIN Wei-zhong,XIAO Xuan. Predict protein structural classes based on GM (1,1) modeling[J]. Computer Engineering and Applications, 2007, 43(34): 41-42 |
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| Authors: | LIN Wei-zhong XIAO Xuan |
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| Affiliation: | Information Engineering School，Jingdezhen Ceramic Institute，Jingdezhen，Jiangxi 333403，China |
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| Abstract: | Protein secondary structure prediction is the hot of bioinformatics.By using digital encoding,amino acid sequence will be converted into digital signals,and the protein GM(1,1) model parameters which are used as a pseudo-amino acid composition are got.As a result of these pseudo-amino acids is described amino acid sequence of the overall characteristic,a prediction success rate is improved largely. |
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| Keywords: | protein predict protein second structural classes Grey Modeling GM(1 1) |
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