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| 抑制剂PMI与MDM2结合模式的分子动力学研究 | |
| 引用本文： | 时术华,陈建中,张庆刚,张少龙. 抑制剂PMI与MDM2结合模式的分子动力学研究[J]. 山东建筑大学学报, 2013, 28(2) |
| 作者姓名： | 时术华 陈建中 张庆刚 张少龙 |
| 作者单位： | 1. 山东建筑大学理学院,山东济南,250101 2. 山东交通学院理学院,山东济南,250023 3. 山东师范大学物理与电子科学学院,山东济南,250014 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，山东省自然科学基金项目，山东建筑大学博士科研基金项目 |
| 摘 要： | p53-MDM2相互作用已经成为治疗癌症药物设计的重要靶标.采用分子动力学模拟和MM-PBSA方法计算了肽类抑制剂PMI与MDM2的绝对结合自由能,通过基于残基的自由能分解方法计算了MDM2的各残基与PMI的相互作用.结果表明:CH-π、CH-CH和π-π相互作用驱动了PMI在MDM2疏水性裂缝中的结合；相关矩阵的计算表明PMI在一定程度上诱导了MDM2内部的相关运动. |
| 关 键 词： | 物理化学 p53-MDM2相互作用 分子动力学模拟 相关矩阵 PMI |
Insights into binding modes of inhibitors PMI to MDM2 based on molecular dynamics simulations |
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| Abstract: | |
| Keywords: | physical chemistry p53-MDM2 interaction molecular dynamics simulation cross-correlation matrixes PMI |
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