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数据挖掘鉴定PRIM1与肝细胞癌不良预后相关
引用本文:丁庆林,魏艳红,胡康洪. 数据挖掘鉴定PRIM1与肝细胞癌不良预后相关[J]. 湖北工业大学学报, 2022, 37(1): 71-76. DOI: 10.3969/j.issn.1003-4684.2022.01.014
作者姓名:丁庆林  魏艳红  胡康洪
作者单位:湖北工业大学中德生物医学中心,湖北武汉430068
摘    要:对DNA引物酶亚基1(DNA primase polypeptide 1,PRIM1)与肝细胞癌(Liver Hepatocellular Carcino-ma,LIHC)不良预后的相关性进行生物信息学研究.作为关键的酶促成分,PRIM1对DNA的合成至关重要.在TIMER数据库中发现,PRIM1在多种癌症中失调,且在LIHC中显著上调,提示其可能参与人类癌症发生发展进程.基因表达综合数据库的LIHC相关数据集以及细胞系和组织证实了PRIM1高表达.经对UALCAN数据库亚组分析,不同种族和亚型的LIHC患者中PRIM1的表达均上调,可辅助判断患者临床病例特征.从cBioPortal数据库中发现PRIM1出现基因组改变,包括拷贝数扩增和意义不明的错义突变和截断突变可能与LIHC发展有关.对PRIM1共表达基因进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书富集分析,结果揭示了其涉及的生物学过程和功能.通过Kaplan-Meier Plotter数据库分析PRIM1的预后价值表明,高PRIM1表达与LIHC不良预后显著相关.数据挖掘揭示了PRIM1在LIHC中表达和突变的数据,且与LIHC不良预后相关.

关 键 词:DNA引物酶亚基1  肝细胞癌  疾病预后

Data Mining Identifies PRIM1 Associated with Poor Prognosis of Hepatocellular Carcinoma
DING Qinglin,WEI Yanhong,HU Kanghong. Data Mining Identifies PRIM1 Associated with Poor Prognosis of Hepatocellular Carcinoma[J]. Journal of Hubei University of Technology, 2022, 37(1): 71-76. DOI: 10.3969/j.issn.1003-4684.2022.01.014
Authors:DING Qinglin  WEI Yanhong  HU Kanghong
Abstract:
Keywords:
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