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格子模型中蛋白质折叠的有效运动集
引用本文:李小妹.格子模型中蛋白质折叠的有效运动集[J].计算机科学,2007,34(10):177-180.
作者姓名:李小妹
作者单位:广东工业大学计算机学院,广州,510006
摘    要:改进的遗传算法应用格子模型的一种新的运动集来优化蛋白质折叠过程。该新的运动集包含所有对称构象以及传统的运动模式,使其更适用于蛋白质折叠模拟。通过在格子模型中的实验我们发现,利用新的运动集明显优于传统使用的运动集。改进的遗传算法是一种进化算法,该算法适合搜索任何HP序列。

关 键 词:蛋白质折叠  格子模型  运动集

A New Move Set for Protein Folding in Lattice Model
LI Xiao-Mei.A New Move Set for Protein Folding in Lattice Model[J].Computer Science,2007,34(10):177-180.
Authors:LI Xiao-Mei
Affiliation:Faculty of Computer, Guangdong University of Technology, Guangzhou 510006
Abstract:An improved genetic algorithm applies the optimization procedures of protein folding through defining a new move set in lattice model.The new move set including rotation and mirror reflection is suitable for use in protein fold- ing simulation.Through folding simulation on a simple lattice model it is found that the new move set is dramatically superior to that of the commonly used move set.
Keywords:Protein folding  Lattice model  Move set
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