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基于AFM成像的DNA长度的计算机统计处理
引用本文:陈新庆,张益,胡钧,吴世英,黄一波,艾小白,邱锡钧,李民乾. 基于AFM成像的DNA长度的计算机统计处理[J]. 核技术, 2001, 24(8): 630-650
作者姓名:陈新庆  张益  胡钧  吴世英  黄一波  艾小白  邱锡钧  李民乾
作者单位:1. 上海大学
2. 中国科学院上海原子核研究所
基金项目:中国科学院生物科学与生物技术特别支持项目 (STZ - 0 0 - 0 7),国家自然科学基金委九 .五重大交叉资助项目( 19890 3 85 ),国家杰出青年基金资助项目 ( 1972 5 4 15 ),中国科学院九 .五重点基础研究资助项目 (KJ95 2 -J1-4 69),上海优秀学科带头人资助计划 (
摘    要:利用计算机图像处理技术 ,对自然沉积DNA和拉直DNA分子AFM图像的长度进行了自动统计测量 ,并与DNA分子的理论长度进行了比较。该方法在DNA分子的AFM图像的基础上 ,将DNA分子拟合成曲线 ,用插值法求得DNA分子长度 ,整个过程实现了自动化。结果表明 ,该方法测得自然沉积的某DNA分子长度为 (180 .4± 16.4 )nm ,与理论长度 185 .0nm相当符合。该方法与拉直法和直接法求DNA分子长度相比是一次改进 ,也为其它基于AFM图像的线状物体求长度提供了一种新的测量方法。对另一组拉直DNA测量的结果表明 :拉直后DNA分子长度为 (34 3.6± 2 0 .7)nm ,与理论长度 30 7.0nm相比明显变长 ,这表明对自然沉积DNA进行长度测量的必要性 ,保证了DNA分子的长度不受拉直后有所伸长的影响。

关 键 词:图像处理 DNA AFM MATLAB 计算机统计处理 长度测量 原子力显微镜
修稿时间:2000-06-19

Statistical length of DNA based on AFM image measured by a computer
CHEN Xinqing ZHANG Yi HU Jun WU Shiying HUANG Yibo AI Xiaobai QIU Xijun LI Minqian. Statistical length of DNA based on AFM image measured by a computer[J]. Nuclear Techniques, 2001, 24(8): 630-650
Authors:CHEN Xinqing ZHANG Yi HU Jun WU Shiying HUANG Yibo AI Xiaobai QIU Xijun LI Minqian
Affiliation:CHEN Xinqing 2 ZHANG Yi 1 HU Jun 1 WU Shiying 1 HUANG Yibo 1 AI Xiaobai 1 QIU Xijun 2 LI Minqian 1 1
Abstract:
Keywords:Image processing   DNA   AFM   MATLAB
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