蓖麻DNA糖基化酶的序列与基因表达分析 |
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引用本文: | 代梦媛,敖涛,徐伟,刘爱忠.蓖麻DNA糖基化酶的序列与基因表达分析[J].中国油料,2014(2):181-188. |
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作者姓名: | 代梦媛 敖涛 徐伟 刘爱忠 |
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作者单位: | [1]中国科学院西双版纳热带植物园热带植物资源开放实验室,云南勐腊666303 [2]中国科学院昆明植物研究所,云南昆明650201 [3]中国科学院大学,北京100049 |
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基金项目: | 中国科学院重点方向性项目(KSCX2-EW-Z-15) |
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摘 要: | 为揭示DNA糖基化酶在调节蓖麻生长发育和影响基因印记过程中的分子机理,本研究基于蓖麻全基因组、利用生物信息学的方法结合转录组数据和RT-PCR半定量表达分析,鉴别蓖麻DNA糖基化酶氨基酸序列的结构特征、系统发生和表达形式。结果显示:三种DNA糖基化酶(DME、ROS和DML)氨基酸均为不稳定氨基酸,具有典型的与DNA结合和碱基切除修复有关的保守结构域;系统进化分析发现三种DNA糖基化酶在植物中同源性强,而且是独立演化的结果;在不同组织的表达上,蓖麻的DME和ROS基因具有相似的表达形式,即在根、茎和叶中不表达,在胚乳中表达最高,而DML在各个组织中都未检测到基因的表达。
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关 键 词: | 蓖麻 DNA糖基化酶 脱甲基化 表观调控 |
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