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一种适用于基因表达数据的特征加权FCM算法*
引用本文:袁正午,魏荣,叶明星.一种适用于基因表达数据的特征加权FCM算法*[J].计算机应用研究,2010,27(7):2483-2485.
作者姓名:袁正午  魏荣  叶明星
作者单位:重庆邮电大学,计算机科学与技术学院,重庆,400065
基金项目:国家“863”计划资助项目(2007AA12Z226)
摘    要:针对FCM算法应用于基因表达数据分析时存在的局限性,提出一种特征加权自适应FCM算法。该算法在FCM算法的基础上引入数据集预处理机制,可依据数据集的分布特征自适应地获取分类数目和初始聚类中心,并通过ReliefF算法实现特征权值的自动确定。同时,新算法考虑了不同属性对分类贡献的差异,在FCM算法中引入特征权重。将算法应用于真实基因表达数据集,实验结果表明,算法能够自适应地确定聚类数目、获得稳定性较好的聚类结果,而且具有较高的聚类精度。

关 键 词:基因表达数据  预处理算法  类间熵  加权模糊聚类

Feature weight-based FCM clustering algorithm for gene expression data
YUAN Zheng-wu,WEI Rong,YE Ming-xing.Feature weight-based FCM clustering algorithm for gene expression data[J].Application Research of Computers,2010,27(7):2483-2485.
Authors:YUAN Zheng-wu  WEI Rong  YE Ming-xing
Affiliation:(Dept. of Computer Science & Technology, Chongqing University of Posts & Telecommunications, Chongqing 400065, China)
Abstract:
Keywords:gene expression data  pre-processing algorithm  inter-cluster entropy  weighted fuzzy clustering
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