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基于距离矩阵灰度图的蛋白质二级结构类型预测*
引用本文:肖绚,肖纯材,王普.基于距离矩阵灰度图的蛋白质二级结构类型预测*[J].计算机应用研究,2010,27(10):3698-3700.
作者姓名:肖绚  肖纯材  王普
作者单位:景德镇陶瓷学院,机电学院,江西,景德镇,333403
基金项目:国家自然科学基金资助项目(60961003);国家教育部科学技术研究重点项目(210116);江西省自然科学基金资助项目(2009GZS0064);江西省教育厅科研基金资助项目(GJJ09271);江西省青年科学家(井冈之星)培养对象基金资助项目
摘    要:蛋白质二级结构预测在蛋白质结构预测中具有很重要的作用。基于伪氨基酸成分表示蛋白质的方法,能提高蛋白质结构和功能预测的成功率,利用蛋白质距离矩阵灰度图,基于几何矩提出了一种伪氨基酸构造方法,结合氨基酸的成分对蛋白质二级结构类型进行预测,通过国际公认的Jackknife检验方法显示预测成功率达到95.10%,比其他方法高出许多,说明此方法具有有效的分类效果。

关 键 词:蛋白质二级结构  距离矩阵  模糊K近邻  几何矩  Jackknife测试

Secondary structure prediction by grayscale image of distance matrix
XIAO Xuan,XIAO Chun-cai,WANG Pu.Secondary structure prediction by grayscale image of distance matrix[J].Application Research of Computers,2010,27(10):3698-3700.
Authors:XIAO Xuan  XIAO Chun-cai  WANG Pu
Abstract:
Keywords:secondary structure prediction  distance matrix  fuzzy K-nearest neighbor  geometric moment  Jackknife cross-validation
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