| 聚类分析在基因表达数据上的应用研究 |
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| 引用本文： | 邓庆山. 聚类分析在基因表达数据上的应用研究[J]. 计算机工程与应用, 2005, 41(35): 210-212 |
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| 作者姓名： | 邓庆山 |
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| 作者单位： | 江西财经大学软件学院,南昌,330013 |
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| 摘 要： | 文章讨论了自组织映射、K平均值聚类和一种有效性测度Silhouette指数。针对基因微阵列的数据特点,考虑到自组织映射的优缺点,设计并实现了一种基于聚类有效性测度的自组织映射和K平均值聚类相结合的一种聚类模型。将该模型运用于公开的结肠基因表达数据集和白血病数据集,实验结果表明该模型是行之有效的。
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| 关 键 词： | 基因表达数据 聚类 SOM K平均值聚类 |
| 文章编号： | 1002-8331-（2005）35-0210-03 |
| 收稿时间： | 2005-02-01 |
| 修稿时间： | 2005-02-01 |
Clustering on Gene Expression Data |
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| Deng Qingshan. Clustering on Gene Expression Data[J]. Computer Engineering and Applications, 2005, 41(35): 210-212 |
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| Authors: | Deng Qingshan |
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| Affiliation: | School of Software,Jiangxi University of Finance and Economics,Nanchang 330013 |
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| Abstract: | The paper discusses self-organizing feature map(SOM),K-means clustering and a cluster validity measure,Silhouette index.Considering the character of microarry and SOM,we design and implement a model associating SOM with K-means clustering based on a cluster validity measure.When we apply the model to the gene expression data of leukaemia and colon,good experimental results are gained.It is proved that the model is effective. |
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| Keywords: | gene expression data clustering SOM K-means clustering |
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