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食品中椰毒假单胞菌酵米亚种实时荧光PCR检测的研究
引用本文:林 捷,方陈玉,陆晶芳,尹丹韩,赵奇琦,王加胜.食品中椰毒假单胞菌酵米亚种实时荧光PCR检测的研究[J].食品安全质量检测技术,2020,11(11):3538-3544.
作者姓名:林 捷  方陈玉  陆晶芳  尹丹韩  赵奇琦  王加胜
作者单位:杭州市食品药品检验研究院
摘    要:目的建立食品中椰毒假单胞菌酵米面亚种实时荧光PCR检测方法。方法根据椰毒假单胞菌酵米面亚种16S~23S rRNA基因片段序列,用Oligo7设计一对特异性引物和一个TaqMan探针,摸索最佳退火温度,最佳引物和探针浓度,建立椰毒假单胞菌酵米面亚种实时荧光PCR检测方法。通过对唐菖蒲伯克霍尔德氏菌以及22种其他标准菌株进行实时荧光PCR检测,验证本法的特异性和抗干扰性。同时从菌液浓度和DNA浓度水平上进行研究,确定该检测方法的灵敏度。结果用该方法检测23种菌,除唐菖蒲伯克霍尔德氏菌外,其他22种细菌均为阴性。抗干扰性试验显示杂菌对检测结果不影响,本法抗干扰能力强。通过灵敏度试验的研究,确定本法检测椰毒假单胞菌酵米面亚种的菌液灵敏度为1×10~2 CFU/mL,DNA灵敏度为250 fg/μL。结论本试验设计的引物和探针具有较强特异性、抗干扰性以及灵敏度,该方法具有很好的研究价值和应用前景。

关 键 词:椰毒假单胞菌酵米亚种  实时荧光PCR  TaqMan探针
收稿时间:2020/3/5 0:00:00
修稿时间:2020/3/31 0:00:00

Detection of Pseudomonas cocovenenans subsp. farinofermentans by fluorescence real-time PCR method
LIN Jie,FANG Chen-Yu,LU Jing-Fang,YIN Dan-Han,ZHAO Qi-Qi,WANG Jia-Sheng.Detection of Pseudomonas cocovenenans subsp. farinofermentans by fluorescence real-time PCR method[J].Food Safety and Quality Detection Technology,2020,11(11):3538-3544.
Authors:LIN Jie  FANG Chen-Yu  LU Jing-Fang  YIN Dan-Han  ZHAO Qi-Qi  WANG Jia-Sheng
Affiliation:Hangzhou Institute for Food and Drug Control
Abstract:
Keywords:Pseudomonas cocovenenans subsp farinofermentans  fluorescence real-time PCR  TaqMan probe
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