| 基于Bayes推断的基因芯片探针特异性估计模型 |
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| 引用本文： | 彭柳,冯圣中.基于Bayes推断的基因芯片探针特异性估计模型[J].计算机工程与应用,2007,43(24):100-103. |
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| 作者姓名： | 彭柳 冯圣中 |
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| 作者单位： | 中国科学院,计算技术研究所,国家智能计算机研究开发中心,中国科学院计算机系统结构重点实验室,北京,100080;中国科学院,研究生院,北京,100039;中国科学院,计算技术研究所,国家智能计算机研究开发中心,中国科学院计算机系统结构重点实验室,北京,100080 |
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| 摘 要： | 序列相似性计算是生物信息处理中的基本问题。针对基因芯片设计中的特异性评价问题，基于Bayes推断，建立了DNA序列快速估计算法，该算法不需要序列联配（alignment-free），性能好于广泛应用的相似性计算工具，可以大幅提高基因芯片设计性能。
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| 关 键 词： | 探针设计 序列相似性估计 贝叶斯推断 特异性 |
| 文章编号： | 1002-8331（2007）24-0100-04 |
| 修稿时间： | 2007-04 |
Probe specificity estimation model based on Bayes theory |
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| PENG Liu,FENG Sheng-zhong.Probe specificity estimation model based on Bayes theory[J].Computer Engineering and Applications,2007,43(24):100-103. |
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| Authors: | PENG Liu FENG Sheng-zhong |
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| Affiliation: | 1.Institute of Computing Technology，Chinese Academy of Sciences，Beijing 100080，China 2.Graduate School of Chinese Academy of Sciences，Beijing 100039，China |
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| Abstract: | Sequence similarity is one of the pivotal problems in field of bioinformatics.This paper proposes a fast DNA sequence similarity estimation method based on Bayes theory. The algorithm is alignent-free,outperformances current similarity alignment algorithms,and can greatly improve the performance of Gen Chip design. |
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| Keywords: | probe design sequence similarity estimation Bayes theory specificity |
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