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LDecode:具有线性复杂度的GEP适应度评价算法
引用本文:陈瑜,唐常杰,李川.LDecode:具有线性复杂度的GEP适应度评价算法[J].四川大学学报(工程科学版),2008,40(1):107-112.
作者姓名:陈瑜  唐常杰  李川
作者单位:1. 四川大学,计算机学院,四川,成都,6100642
2. 四川大学,计算机学院,四川,成都,6100642;陕西理工学院,计算机系,陕西,汉中,723003
基金项目:国家自然科学基金 , 国家科技支撑计划
摘    要:基因表达式编程(Gene Expression Programming,GEP)在处理复杂长基因时的空间、时间效率较低,为解决这一问题,提出并实现了具有线性复杂度的染色体适应度评价算法.分析了传统GEP算法中借助ET(Expression Tree)树进行染色体适应度评价的局限性;提出并实现了具有线性复杂度的染色体适应度评价算法LDecode算法;针对染色体长度、种群大小、测试数据集大小、进化代数等不同参数,对提出的染色体适应度评价算法进行了评价和分析.试验表明,提出的评价算法运行速度较传统基于ET树的GEP提高了4.5~5.1倍,时间、空间复杂度均为O(n).

关 键 词:基因表达式编程  表达式树  适应度评价  线性复杂度  适应度  评价算法  Linear  Complexity  Programming  Gene  Expression  Algorithm  Decoding  空间复杂度  时间效率  运行速度  试验  参数  进化代数  测试数据集  大小  染色体长度  Tree  分析  问题
文章编号:1009-3087(2008)01-0107-06
收稿时间:6/1/2007 12:00:00 AM
修稿时间:2007年6月1日

LDecode:A Novel Decoding Algorithm on Gene Expression Programming with Linear Complexity
CHEN Yu,TANG Chang-jie,LI Chuan,QIAO Shao-jie,ZHU Ming-fang.LDecode:A Novel Decoding Algorithm on Gene Expression Programming with Linear Complexity[J].Journal of Sichuan University (Engineering Science Edition),2008,40(1):107-112.
Authors:CHEN Yu  TANG Chang-jie  LI Chuan  QIAO Shao-jie  ZHU Ming-fang
Affiliation:School of Computer Sci., Sichuan Univ., Chengdu 610064, China;School of Computer Sci., Sichuan Univ., Chengdu 610064, China;School of Computer Sci., Sichuan Univ., Chengdu 610064, China
Abstract:The efficiency of gene expression programming (GEP) is low in processing complex gene with large length. In order to solve the problem, a novel algorithm with linear complexity was proposed. The main contributions include: 1) Analyzing the limit in conventional gene expression programming, 2) Proposing a novel LDecode algorithm to evaluate the fitness of chromosome speedy.The extensive experiments demonstrated that this algorithm is faster than traditional one by 4.5~5.1 times on different parameters, and the time complexity and space complexity are linear.
Keywords:Gene Expression Programming(GEP)  expression tree  fitness evaluate
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