| 液相色谱-串联质谱法分析大鼠血液中基因组DNA羟甲基化水平 |
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| 引用本文： | 陈光照,杨柳青,文娟,葛苗苗,张立坚,蔡春. 液相色谱-串联质谱法分析大鼠血液中基因组DNA羟甲基化水平[J]. 质谱学报, 2015, 36(3): 249-254. DOI: 10.7538/zpxb.youxian.2015.0011 |
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| 作者姓名： | 陈光照 杨柳青 文娟 葛苗苗 张立坚 蔡春 |
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| 作者单位： | 1.广东医学院分析中心，广东 湛江524023；2.四川大学华西药学院，四川 成都610041 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(21375029);广东省学科建设基金(2013CXZDA018)资助 |
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| 摘 要： | 5-羟甲基胞嘧啶（5-hydroxymethylcytosine，5hmC）是由TET蛋白家族催化氧化5-甲基胞嘧啶-（5-methylcytosine，5mC）生成的，对哺乳动物的基因转录和表达发挥着重要的调控作用。本研究建立了血液样品中5hmC的液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）测定方法，采用试剂盒法提取血液基因组DNA，在甲酸环境下加热裂解，采用HILIC色谱柱分离，电喷雾电离和多反应监测模式定量。结果表明：5hmC在0.1~50 μg/L范围内线性关系良好，相关系数为0.999 4；高、中、低3个加标水平的平均回收率为95.87%，日内和日间的相对标准偏差分别为3.42%和4.12%；5hmC的检出限（LOD，S/N=3）为0.050 μg/L，定量限（LOQ，S/N=10）为0.100 μg/L。该方法准确、快速、稳定、灵敏，可用于血液样品全基因组中5-羟甲基胞嘧啶的检测分析。
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| 关 键 词： | 5-羟甲基胞嘧啶（5hmC） 液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS） DNA羟甲基化 血液 大鼠 |
Analysis of Global DNA Hydroxymethylation in Rats’ Blood by Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry |
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| CHEN Guang-zhao;YANG Liu-qing;WEN Juan;GE Miao-miao;ZHANG Li-jian;CAI Chun. Analysis of Global DNA Hydroxymethylation in Rats’ Blood by Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry[J]. Journal of Chinese Mass Spectrometry Society, 2015, 36(3): 249-254. DOI: 10.7538/zpxb.youxian.2015.0011 |
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| Authors: | CHEN Guang-zhao YANG Liu-qing WEN Juan GE Miao-miao ZHANG Li-jian CAI Chun |
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| Affiliation: | 1.Analysis Center of Guangdong Medical College, Zhanjiang 524023, China;2.West China School of Pharmacy,Sichuan University, Chengdu 610041, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | 5-hydroxymethylcytosing(5hmC) liquid chromatography-tandem mass spectrometry(LC-MS/MS) DNA hydroxymethylation blood rat |
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