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随机扩增多态性DNA分子标记技术在肠球菌分型中的应用
引用本文:付竹贤,关仁梅,王淑敏,陈偲,罗璠. 随机扩增多态性DNA分子标记技术在肠球菌分型中的应用[J]. 现代食品科技, 2023, 39(11): 86-93
作者姓名:付竹贤  关仁梅  王淑敏  陈偲  罗璠
作者单位:(1.西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部四川省重点实验室,四川成都 610041)(2.西南民族大学畜牧兽医学院,四川成都 610041)
基金项目:四川省自然科学基金面上项目(2022NSFSC0114);西南民族大学研究生创新型科研项目(CX2021SZ14)
摘    要:该研究旨在探索随机扩增多态性DNA(Random Amplified Polymorphic DNA,RAPD)分子标记技术在肠球菌种间快速分型的效果。试验通过筛选模板、单引物、双引物及RAPD反应体系,构建肠球菌种间分型体系,对32株已知肠球菌分型确定分型相似度标准,并通过对46株未知肠球菌进行种间分型以及管家基因rpoA测定验证分型效果。结果显示微波法提取基因组DNA满足实验需要,筛选出7条单引物用于双引物配对组合,最适的双引物反应体系为:2×PCR Taq Mix 12.5 μL,模板DNA 1 μL,引物各1 μL,ddH2O 9.5 μL;分型效果最好的双引物组合为Primer1+Primer5,该引物组合可以在80%的相似度下区分肠球菌种间差异,Primer1+Primer3组合在500 bp位置扩增出海氏肠球菌的特征条带,可以作为海氏肠球菌的鉴定指标,用以快速鉴定海氏肠球菌。

关 键 词:肠球菌  随机扩增多态性DNA  双引物  体系优化
收稿时间:2022-11-28

Application of Random Amplified Polymorphic DNA Molecular Marker Technique in Typing of Enterococcus
FU Zhuxian,GUAN Renmei,WANG Shumin,CHEN Cai,LUO Fan. Application of Random Amplified Polymorphic DNA Molecular Marker Technique in Typing of Enterococcus[J]. Modern Food Science & Technology, 2023, 39(11): 86-93
Authors:FU Zhuxian  GUAN Renmei  WANG Shumin  CHEN Cai  LUO Fan
Affiliation:(1.Key Laboratory of Qinghai-Tibetan Plateau Animal Genetic Resource Reservation and Utilization, Ministry of Education, Sichuan Province, Southwest Minzu University, Chengdu 610041, China)(2.College of Animal and Veterinary Sciences, Southwest Minzu University, Chengdu 610041, China)
Abstract:
Keywords:Enterococcus   random amplified polymorphic DNA   pairs of primer   system optimization
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