| 人呼吸道合胞病毒兰州株全基因组序列测定及分析 |
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| 引用本文： | 朱传凤,瓦晓霞,傅生芳,马超. 人呼吸道合胞病毒兰州株全基因组序列测定及分析[J]. 中国生物制品学杂志, 2019, 0(7): 735-741 |
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| 作者姓名： | 朱传凤 瓦晓霞 傅生芳 马超 |
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| 作者单位： | 兰州生物制品研究所有限责任公司 |
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| 摘 要： | 目的为了解人呼吸道合胞病毒(human respiratory syncytium virus,HRSV)兰州株(HRSV LZ01/09)的遗传特征及分子进化规律,进一步丰富RSV基因组数据库,对HRSV LZ01/09的全基因组序列进行测定及分析。方法通过RT-PCR法对HRSV LZ01/09全基因组片段进行扩增及序列测定,利用分子生物学软件对测序结果进行拼接,并与GenBank登录的RSV实验参比株和各基因型代表株进行分子进化分析。结果 HRSV LZ01/09全基因组全长为15204 bp,基因组的结构为NS1-NS2-N-P-M-SH-G-F-M2-1-M2-2-L,与报道的RSV实验参比株相同;全基因组序列比对分析表明,HRSV LZ01/09兰州株基因组序列与RSV RSS2株的同源性最高,为96. 7%,与其他RSV-A亚型毒株同源性次之,为94. 9%~95. 2%,与RSV-B亚型9320株同源性最低,为80.9%;依据RSV-G基因的第2个可变区进行系统进化树分析,HRSV LZ01/09兰州株基因组与NA1病毒分离株属于同一个分支。结论HRSV LZ01/09兰州株病毒基因组具有RSV的遗传特征,属于RSV-A亚型,基因型属于NA1型。
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| 关 键 词： | 呼吸道合胞病毒 全基因组序列测定 同源性 系统进化树分析 |
Whole-genome sequencing and analysis of human respiratory syncytium virus LZ01/09 strain |
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| ZHU Chuan-feng,WA Xiao-xia,FU Sheng-fang,MA Chao. Whole-genome sequencing and analysis of human respiratory syncytium virus LZ01/09 strain[J]. Chinese Journal of Bilogicals, 2019, 0(7): 735-741 |
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| Authors: | ZHU Chuan-feng WA Xiao-xia FU Sheng-fang MA Chao |
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| Affiliation: | (Lanzhou Institute of Biological Products Co.,Ltd.,Lanzhou 730046,Gansu Province,China) |
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| Abstract: | ZHU Chuan-feng;WA Xiao-xia;FU Sheng-fang;MA Chao(Lanzhou Institute of Biological Products Co.,Ltd.,Lanzhou 730046,Gansu Province,China) |
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| Keywords: | Respiratory syncytium virus(RSV) Whole genome sequencing Homology Phylogenetic analysis |
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